【发布时间】:2015-09-13 15:44:16
【问题描述】:
我试图弄清楚如何将 lambda 函数同时应用于多个数据帧,而无需先将数据帧合并在一起。我正在处理大型数据集(>60MM 记录),我需要格外小心内存管理。
我希望有一种方法可以将 lambda 应用到底层数据帧,这样我就可以避免先将它们拼接在一起,然后在继续下一步之前从内存中删除中间数据帧的成本过程。
我有使用基于 HDF5 的数据帧来避免内存问题的经验,但我宁愿先尝试探索不同的东西。
我提供了一个玩具问题来帮助演示我在说什么。
import numpy as np
import pandas as pd
# Here's an arbitrary function to use with lambda
def someFunction(input1, input2, input3, input4):
theSum = input1 + input2
theAverage = (input1 + input2 + input3 + input4) / 4
theProduct = input2 * input3 * input4
return pd.Series({'Sum' : theSum, 'Average' : theAverage, 'Product' : theProduct})
# Cook up some dummy dataframes
df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(6,2),columns=list('AB'))
df2 = pd.DataFrame(np.random.randn(6,1),columns=list('C'))
df3 = pd.DataFrame(np.random.randn(6,1),columns=list('D'))
# Currently, I merge the dataframes together and then apply the lambda function
dfConsolodated = pd.concat([df1, df2, df3], axis=1)
# This works just fine, but merging the dataframes seems like an extra step
dfResults = dfConsolodated.apply(lambda x: someFunction(x['A'], x['B'], x['C'], x['D']), axis = 1)
# I want to avoid the concat completely in order to be more efficient with memory. I am hoping for something like this:
# I am COMPLETELY making this syntax up for conceptual purposes, my apologies.
dfResultsWithoutConcat = [df1, df2, df3].apply(lambda x: someFunction(df1['A'], df1['B'], df2['C'], df3['D']), axis = 1)
【问题讨论】:
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很难理解这是否值得回答,因为您当前的问题可以在不应用 lambda 和连接的情况下解决,您能否解释一下您真正想要实现的目标跨度>
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在我的示例代码中,我从三个数据帧 [df1, df2, df3] 开始。然后我需要创建一个名为 dfConsolodated 的中间数据帧,它只是三个基础数据帧全部连接在一起。这对玩具问题很好,但是当我在每个数据帧上处理超过 6000 万条记录时,我可以使用 dfConsolodated 表快速膨胀内存。真正的目标是首先通过避免 concat 来节省系统资源。
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所有的DataFrames的形状都一样吗?
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某种程度上,它们具有相同的索引。它们垂直高度相同,但宽度可能不同。
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如果内存是您的限制条件,您可以通过连接 DataFrame 来坚持原来的工作流程。但是,请尝试分批处理它们(例如 1m 行),然后将结果连接起来。
标签: python memory pandas lambda dataframe