R：从包A中的源代码链接到包B中的数据答案

【问题标题】：R: Linking to data in package B from source code in package AR：从包A中的源代码链接到包B中的数据
【发布时间】：2014-01-08 20:04:05
【问题描述】：

我正在构建一个包含大量内部数据的新 R 包。我决定将包分成两部分：A（包含源代码）和 B（包含数据）。这符合官方 CRAN 政策。数据至关重要，没有它，软件包就无法运行。

我无法从 A 中的源代码链接到 B 中的数据。A 中的所有源代码都在目录 R/ 中，而 B 中的所有数据都在目录 data/ 中。假设dat是B中唯一的数据文件。我尝试了以下：

在 B 的 DESCRIPTION 文件中启用 LazyData: true，这将导出数据文件。在 A 中，我通过B::dat 访问源代码中的数据。问题：R CMD check 提出了一个注释，指出 B::dat 尚未定义，CRAN 维护人员声称这是不好的做法。
将 B 中的所有数据保存到 R/ 目录中的 sysdata.rda 中，并使用 A 中的 B:::dat 引用它。问题：CRAN 维护人员声称这是一种不好的做法，因为所有数据都应该在 @987654332 中@，不在R/ 中。此外，这样您就无法在man/ 中记录数据文件。
无法使用NAMESPACE 文件使用export(dat) 命令导出B 中的数据。
data(dat,package="B") 将数据加载到全局环境中，但作为内部数据，它不应该对用户可见，因此这不起作用。
data(dat,package="B",envir=environment())将数据加载到函数调用的本地环境中，但是每次调用函数（可以是多次），加载数据的时间很长，导致计算速度太慢。我也尝试直接加载到包命名空间，但这些命名空间被锁定，这是不允许的。我们如何让数据直接加载到包命名空间中？

关于如何解决这个问题有什么建议吗？这样做的正确方法是什么？理想情况下，数据位于包 B 中的 data/ 目录中，并且包 A 中的源代码在访问它时没有问题。谢谢！

【问题讨论】：

标签： r package

【解决方案1】：

一个非常简单的解决方案：

在包 A 的 DESCRIPTION 文件中，它应该包含 Depends: B。我发现使用Imports: B 将不用于导入数据文件，除非它们在sysdata.rda 中。此外，包 B 的 NAMESPACE 文件默认应包含以下内容：

exportPattern(".")

这样你就可以在包A的任意源码中直接引用dat了。

【讨论】：

【解决方案2】：

为什么不保持简单明了：data(someData, package="A")？

让它神奇地工作（就像数据来自同一个包时一样）是可能的；有一些包（例如SOAR）通过延迟加载和按需加载来实现技巧。

编辑： 想想看，CRAN 上有很多 data 包。你学过那些吗？例如，TH.data 由 Torsten 设置用于 is 包。这不是你的用例吗？也许你会在它的设置中找到相关的技巧。

【讨论】：