如何在 R 中读取 .edges 文件？答案

【问题标题】：How to read in .edges file in R?如何在 R 中读取 .edges 文件？
【发布时间】：2019-10-12 02:43:45
【问题描述】：

我从网络存储库 (http://networkrepository.com/actor-movie.php) 下载了一个网络对象。但我未能使用 igraph::read.graph 在 R 中加载此 .edges 文件，但出现以下错误：

dat <- read.graph("actor-movie.edges")

Error in read.graph.edgelist(file, ...) : 
  At foreign.c:101 : parsing edgelist file failed, Parse error

有人知道如何在 R 中加载这个网络吗？

【问题讨论】：

标签： r igraph

【解决方案1】：

我认为 igraph::read_graph 的错误是由分隔符引起的——在文件中它是逗号分隔的，但函数需要format="edgelist" 的空格。但是，我们可以使用标准导入工具将 fie 作为数据框读取。然后可以使用igraph函数来形成图形。

# download
pth <- "http://nrvis.com/download/data/misc/actor-movie.zip"
download.file(pth, destfile = "actor-movie.zip")

# see file names
unzip("actor-movie.zip", list = TRUE)

# unzip
unz <- unzip("actor-movie.zip", "actor-movie.edges")

# quick look : looks like edge list
readLines(unz, n=10)

# skip first line to avoid % bipartite unweighted" 
dat <- read.table(unz, skip=1, sep=",")

# look
head(dat)
str(dat)

# load as a graph
library(igraph)

g <- graph_from_data_frame(dat)
g

【讨论】：