【问题标题】:Cubism with genomic data (or non-timeseries data)带有基因组数据(或非时间序列数据)的立体主义
【发布时间】:2013-07-24 20:10:42
【问题描述】:

我想听听您对如何让立体主义与非时间序列数据(具体而言是基因组数据)一起工作的想法。

这些类型的数据有一个轨迹(一条染色体和该染色体内的坐标)而不是时间戳:

chrm1 145678123 value
chrm12 45345 value
chrmX 4535 value
....

您认为哪个选项最好,破解立体主义的核心以允许这些类型的数据(或任何类型的数据)或一起产生一个新项目?

更新:我决定为 DNA 实施一个修改版的立体主义。我称之为 DNAism,你可以找到它here。看看,让我知道你的想法。

-drd

【问题讨论】:

  • 我正在研究一个类似的问题:如何通过 d3 显示基因组数据。会对解决方案感兴趣。
  • 检查我的解决方案here

标签: d3.js cubism.js


【解决方案1】:

Cubism 可能不适合这项任务。您将不得不以非常重要的方式修改库。我建议您不要这样做,而是使用d3.horizon 插件,这样您就可以通过创建自定义比例来获得更多控制权。

希望这能回答你的问题。

【讨论】:

  • 感谢您的回答。
  • 感谢您的回答。这些改变可能很难做出,但立体主义解决的问题与我想要做的基本相同。我目前正在检查代码。让我们看看是否有其他人参与进来。
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