在多个文件上运行脚本

Question

我想对所有扩展名为 .xml 的一批文件执行script。

受以前帖子的启发，我尝试了以下方法：

for file in *.xml; do ./script.sh <"$file"; done

和

for i in $(\ls -d *.xml)
do
    ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder $i
done

这两个都多次运行脚本，但仅在该文件夹中的第一个 .xml 文件上运行。所以我最终得到了十几个输出文件，但它们都是 file1.txt、file1.txt_1、file1.txt_2 等。循环随机停止，有时在 3 次迭代后，有时在 28 次后。

任何帮助将不胜感激， 谢谢， TP

Answer 1

for f in /input_path/*.xml; do
  ./interproscan.sh -mode convert -f raw -i "$f" -d /output_path
done

Answer 2

更简单安全的方法是这样的：

while IFS=  read -r -d $'\0'; do
    ./interproscan.sh -mode convert -f raw -i "$REPLY" -d /output_path
done < <(find . -iname "*.xml" -print0)

注意

1) 使用不区分大小写的 iname 进行搜索。

2) "$variable" 在文件名有空格时帮助你。

Answer 3

您可以使用 find 的 -exec 选项来代替循环遍历文件。它将对每个文件执行命令，将{} 替换为文件的路径。请注意，您必须以 转义 分号 (\;) 结束命令。

这样的事情可能对你有用：

find . -name "*.xml" -exec ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder {} \;

但您只能插入一次{}，但也可以使用循环执行此操作：

xmlFiles=( $(find . -name "*.xml") )
for i in ${xmlFiles[@]}
do
   ./script.sh -i /path/*.xml -d /output_folder $i
done