Incanter-numpy 互操作

Question

我想使用 Clojure 的 Incanter，但我想混合调用 Python 广泛的 Numpy/Scipy 数值库。 Incanter 和 Numpy 之间是否存在互操作性桥梁，允许从 Clojure 运行 CPython 的嵌入式运行时，并且可以相互转换 Numpy 和 Incanter 的矩阵数据结构？

Jython 还不够，因为 Numpy 需要 CPython。

我知道（但从未使用过）http://jepp.sourceforge.net/，它允许 Java 程序控制嵌入式 CPython 运行时——但仍然需要 Numpy/Incanter 矩阵相互转换。

我正在寻找类似于 https://github.com/jolby/rincanter 的东西（我还没有使用过）但用于 CPython/Numpy 而不是 R。

Answer 1

没有现成的 numpy-incanter 桥。你必须自己写。

一种方法是使用 JNI resp。 Jepp 和 - 正如你已经说过的 - 将原始 ndarray 字节转换为 Java Colt 库可以使用的东西（反之亦然； incanter 建立在 Colt 之上）。此外，您已经包装了您感兴趣的所有功能。

另一种方法是序列化 ndarray 并在 CPython 和 Jython 之间发送它们（例如使用 Pyro，可与 CPython 和 Jython 一起使用：http://packages.python.org/Pyro4/alternative.html#jython）。同样，您必须将原始字节转换为 Incanter 相应的内容。 numpy 可以理解，但您可以在 Java 端使用 Python 代码，而无需使用 JNI 将每个函数包装在 numpy/scipy 中。