使用 leidenalg 和 igraph 查找簇，然后输出 gml 文件

【问题标题】：Use leidenalg and igraph to find cluster and then output gml file使用 leidenalg 和 igraph 查找簇，然后输出 gml 文件
【发布时间】：2021-01-25 21:34:04
【问题描述】：

import leidenalg as la

import igraph as ig

G = ig.Graph.Famous('Zachary')

partition = la.find_partition(G, la.ModularityVertexPartition)

ig.plot(partition,vertex_size = 30)

ig.save(G,'ttt.gml')

一切正常，但是 ig.save 不包含集群信息，仅包含节点和边。 ttt.gml文件中需要给节点添加集群信息

【问题讨论】：

标签： python igraph gml

【解决方案1】：

图本身不包含分区的任何信息。您应该先将此信息添加到图表中，然后再通过 G.vs['cluster'] = partition.membership 进行保存。

【讨论】：

谢谢，刚刚成功！将 gml 文件加载到 Gephi 并验证它是否有效。
太好了，很高兴听到。请注意，Leiden 算法也可以作为 Gephi 的插件使用，所以如果这就是您在 igraph 中所做的一切，您也可以在 Gephi 本身中执行此操作。