【发布时间】：2016-07-05 18:47:29
【问题描述】：
我是 bash 脚本的新手。我想逐行读取包含表格的文件。在每一行，我想将值分配给变量。这基本上是我的代码格式：
#!/bin/bash
while IFS= read -r line; do
echo $a $b $c $d
#if statements…
done < test.txt
我收到此错误：“While 循环错误：意外标记 `done' 附近的语法错误”
知道我的代码有什么问题吗？我尝试查看与同一错误相关的其他几个问题，但我无法修复我的代码。感谢您的帮助！
编辑：这是整个代码。它可能还有其他错误（我真的是初学者），但我希望它有所帮助。
#!/bin/bash
experiment_database="/home/gperron/datasets/ENCODE_tables/final_tables/test_experiment_database.txt"
file_database="/home/gperron/datasets/ENCODE_tables/final_tables/test_file_database.txt"
EXPERIMENT=`cat $experiment_database | head -n $PBS_ARRAYID | tail -n 1 | cut -f1`
echo "EXPERIMENT #$PBS_ARRAYID: $EXPERIMENT"
while IFS= read -r line; do
echo $file_ID $experiment $target $biological_replicate $technical_replicate $read_number $url $fastq_file $genome
if [ "$experiment" == "$EXPERIMENT" ]; then
if [ $biological_replicate == 1 ]; then
if [ $technical_replicate == 1 ]; then
if [ $read_number == 1 ]; then
ID_111= $file_ID
fastq_111= $fastq_file
url_111= $url
echo "FASTQ file 111 ID: $ID_111"
echo "FASTQ file 111: $fastq_111"
echo "FASTQ file 111 url: $url_111"
elif [ $read_number == 2 ]; then
ID_112= $file_ID
fastq_112= $fastq_file
url_112= $url
echo "FASTQ file 112 ID: $ID_112"
echo "FASTQ file 112: $fastq_112"
echo "FASTQ file 112 url: $url_112"
fi
elif [ $technical_replicate == 2 ]; then
if [ $read_number == 1 ]; then
ID_121= $file_ID
fastq_121= $fastq_file
url_121= $url
echo "FASTQ file 121 ID: $ID_121"
echo "FASTQ file 121: $fastq_121"
echo "FASTQ file 121 url: $url_121"
elif [ $read_number == 2 ]; then
ID_122= $file_ID
fastq_122= $fastq_file
url_122= $url
echo "FASTQ file 122 ID: $ID_122"
echo "FASTQ file 122: $fastq_122"
echo "FASTQ file 122 url: $url_122"
fi
elif [ $biological_replicate == 2 ]; then
if [ $technical_replicate == 1 ]; then
if [ $read_number == 1 ]; then
ID_211= $file_ID
fastq_211= $fastq_file
url_211= $url
echo "FASTQ file 211 ID: $ID_211"
echo "FASTQ file 211: $fastq_211"
echo "FASTQ file 211 url: $url_211"
elif [ $read_number == 2 ]; then
ID_212= $file_ID
fastq_212= $fastq_file
url_212= $url
echo "FASTQ file 212 ID: $ID_212"
echo "FASTQ file 212: $fastq_212"
echo "FASTQ file 212 url: $url_212"
fi
elif [ $technical_replicate == 2 ]; then
if [ $read_number == 1 ]; then
ID_221= $file_ID
fastq_221= $fastq_file
url_221= $url
echo "FASTQ file 221 ID: $ID_221"
echo "FASTQ file 221: $fastq_221"
echo "FASTQ file 221 url: $url_221"
elif [ $read_number == 2 ]; then
ID_222= $file_ID
fastq_222= $fastq_file
url_222= $url
echo "FASTQ file 222 ID: $ID_222"
echo "FASTQ file 222: $fastq_222"
echo "FASTQ file 222 url: $url_222"
fi
fi
fi
fi
done < test_file_database.txt
如果我有任何澄清，请告诉我。
【问题讨论】：
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发布循环的内容。你可能有一些未闭合的嵌套结构或不平衡的括号或其他东西。
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我在您发布的代码中没有发现任何错误。创建一个重现问题的最小示例，并将该确切代码复制并粘贴到您的问题中。 （您可能会在缩小测试用例范围的同时自己解决问题；在这种情况下，您可以删除问题或发布答案，具体取决于它是否对其他人有用。）
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您发布的代码显然可以按原样运行
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我编辑了我的帖子并添加了整个代码，也许它会有所帮助。我的其余代码可能会令人困惑，如果我能澄清任何事情，请告诉我！
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基思所说的：创建一个最小的例子。可能是通过删除块，并在每次删除块后检查错误是否仍然存在。 （此时我的假设是您没有正确计算您的 if/fi。
标签： bash syntax while-loop