在 shell 脚本中超时并报告这些输入超时答案

【问题标题】：timeout in shell script and report those input with timeout在 shell 脚本中超时并报告这些输入超时
【发布时间】：2019-03-20 09:30:31
【问题描述】：

我想使用带有数千个输入文件的程序 Arlsumstat_64bit 进行分析。

Arlsumstat_64bit 读取输入文件 (.arp) 并写入结果文件 (sumstat.out)。每个输入都将根据参数“0 1”在结果文件 (sumstat.out) 上附加新行
因此，我编写了一个 shell 脚本来执行同一文件夹中的所有输入 (*.arp)。但是，如果输入文件包含错误，shell 脚本将被卡住而没有任何后续处理。因此，我找到了一个带有“超时”的命令来处理我的问题。我做了一个shell脚本如下

#!/bin/bash

for sp in $(ls *.arp) ; 
do

echo "process start: $sp"


timeout 10 arlsumstat_64bit ${sp}.arp sumstat.out 1 0 

        rm -r ${sp}.res

        echo "process done: $sp"


done

但是，我仍然需要知道哪些输入文件失败了。如何制作一个列表来告诉我哪些输入文件是“超时”的？

【问题讨论】：

建议改进：使用for sp in *.arp 而不是使用ls 的输出。 $sp 将包括.arp，所以它可能应该是arlsumstat_64bit ${sp} sumstat.out 1 0 和rm -r ${sp%.arp}.res。

标签： linux shell timeout

【解决方案1】：

查看timeout 命令http://man7.org/linux/man-pages/man1/timeout.1.html 的手册页

如果命令超时，并且 --preserve-status 未设置，则退出状态为 124。否则，以 COMMAND 状态退出。如果不信号被指定，超时时发送 TERM 信号。术语信号杀死任何不阻塞或捕获该信号的进程。可能需要使用 KILL (9) 信号，因为该信号无法被捕获，此时退出状态为 128+9 而不是 124.

您应该找出程序arlsumstat_64bit 可能的退出代码。我认为它应该在成功时以状态 0 退出。否则下面的脚本将不起作用。如果您需要区分超时和其他错误，则不应使用退出状态124 或timeout 用于指示超时。因此，您可以根据需要检查命令的退出状态，以区分成功、错误或超时。

为了保持脚本简单，我假设您不需要区分超时和其他错误。

我添加了一些 cmets，我在其中修改了您的脚本以改进它或显示替代方案。

#!/bin/bash

# don't parse the output of ls
for sp in *.arp
do

    echo "process start: $sp"

    # instead of using "if timeout 10 arlsumstat_64bit ..." you could also run
    # timeout 10 arlsumstat_64bit...  and check the value of `$?` afterwards,
    # e.g. if you want to distinguish between error and timeout.

    # $sp will already contain .arp so ${sp}.arp is wrong
    # use quotes in case a file name contains spaces
    if timeout 10 arlsumstat_64bit "${sp}" sumstat.out 1 0 
    then
        echo "process done: $sp"
    else
        echo "processing failed or timeout: $sp"
    fi

    # If the result for foo.arp is foo.res, the .arp must be removed
    # If it is foo.arp.res, rm -r "${sp}.res" would be correct
    # use quotes
    rm -r "${sp%.arp}.res"

done

【讨论】：

【解决方案2】：

下面的代码应该适合你：

  #!/bin/bash
  for sp in $(ls *.arp) ; 
  do
  echo "process start: $sp"
  timeout 10 arlsumstat_64bit ${sp}.arp sumstat.out 1 0 
  if [ $? -eq 0 ]
  then
    echo "process done sucessfully: $sp"
  else
    echo "process failed: $sp"
  fi
  echo "Deleting ${sp}.res"
  rm -r ${sp}.res
  done

【讨论】：

应该是 if [ $? -eq 0 ] 。我建议将for 循环体中的行缩进以使脚本更具可读性。