长 R 系统调用挂起

Question

我将非常感谢以下方面的帮助：

我只是在 foreach 中并行运行来自 R 的独立应用程序的 3 个实例。请看下面的模拟代码：

require("foreach")
require("doMC")

registerDoMC(cores=3)
foreach(sample=1:9) %dopar%{
        system2(command="app", args=c("some","args"), 
                stdout = NULL, stderr = NULL) 
}

不管我用system，system2，在任务管理器里我都能看到：

1. rsession（父）
2. 3x rsessions（来自 foreach）
3. 3x 应用（进程）

问题是：parent 使用大量 CPU 并不断消耗 RAM，直到我陷入交换状态。这发生在任何app、foreach 中的任意数量的线程以及基本上来自 R 的任何系统调用（运行时间超过一些可忽略的时间）都会挂起并且永远不会返回。

我的机器有 Debian Jessie 和 R 3.2.3。

提前谢谢你！

Answer 1

好的，我找到了导致问题的原因：RStudio。 rsession 父对象可能正在扫描文件更改并在某处停止直到进程完成。从控制台运行 R 不会出现这样的问题。