为了实现您的目标，并且由于您已经在使用 packaged 属性到 true（稍后解释），您可以简单地将目录添加到下面的路径中。
保持相同的配置，添加一个include 元素，如下所示：
<fileSets>
<fileSet filtered="true" packaged="true" encoding="UTF-8" >
<directory>src/main/java</directory>
<includes>
<include>**/*.java</include>
</includes>
</fileSet>
</fileSets>
然后您可以将您的 Java 源代码 templated 放在 src/main/java/mypackage 下，其中 package 语句如下：
package ${package}.mypackage
注意.mypackage 正好反映了mypackage 文件夹直接位于src/main/java 下。但是，在创建原型时，Maven 会在 ${package} 属性值之间放置一个文件夹（以及包等），默认情况下是 ${groupId}。
您始终可以传递-Dpackage 属性并将其覆盖为默认值（groupId），然后根据上面的模板将其用作包的前缀。
这是因为在上面的fileSet 部分中将packaged 属性设置为true。在这种情况下，true 意味着：将${package} 属性指定的文件夹层次结构添加到其中。将其设置为false 将导致${package} 被忽略，如果您真的想对文件夹结构进行硬编码并将其明显反映到Java 代码的package 语句中，以保持一致性，则可以使用它。
上述行为记录在官方How is metadata about an archetype stored?：
原型定义了一个文件集：
- 文件集将获取
archetype-resources/src/main/java 中与**/*.java 模式匹配的所有文件
- 所选文件将使用 Velocity 引擎 (
filtered=true) 生成
- 文件将在生成项目的
src/main/java 目录中生成，该目录与 JAR 文件中的目录相同，但该目录以package 属性为前缀。
还有：
文件集可以是packaged，这意味着选定的文件将在包属性前面的目录结构中生成/复制。它们可以是非打包的，这意味着将生成/复制选定的文件而无需预先添加。
同样的细节（关于packaged属性）也可以在官方Archetype Descriptor Model中找到。
另一种可能的解决方案是使用附加属性或直接在archetype-metadata.xml 文件中定义您的package 属性值，如下所示：
<archetype-descriptor
xmlns="http://maven.apache.org/plugins/maven-archetype-plugin/archetype-descriptor/1.0.0"
xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/plugins/maven-archetype-plugin/archetype-descriptor/1.0.0 http://maven.apache.org/xsd/archetype-descriptor-1.0.0.xsd">
<fileSets>
<fileSet filtered="true" packaged="true" encoding="UTF-8">
<directory>src/main/java</directory>
</fileSet>
</fileSets>
<requiredProperties>
<requiredProperty key="package">
<defaultValue>${groupId}.${artifactId}.mypackage</defaultValue>
</requiredProperty>
</requiredProperties>
</archetype-descriptor>
注意新的requiredProperties 部分：这里我们为package 属性设置默认值，不再需要在运行时提供它（但可以覆盖上面的值）。
因此，src/main/java（不需要更多静态文件夹）下的 Java 源模板将是：
package ${package}
在创建 (archetype:generate) 期间，Maven 将使用 com.sample.something.mypackage 作为包值（在 Java 源文件中）并使用值 com/sample/something/mypackage 填充 packageInPathFormat 属性（相同的属性，但在路径中格式）并创建所需的包层次结构，与期望放置的 Java 源代码一致。