在 Bash 中，修改文件中的列和行

Question

我有一些文件命名如下：

 d_Ca-1_O_7.dat
 d_Ca-1_O_8.dat
 d_Ca-1_O_14.dat
 d_Ca-1_O_16.dat
 d_Ca-1_O_10.dat

在每个文件中，我都有这样的结构：

 abcA_BCdef  1 G   1     2.4733     4.6738    7 O    0 0 0
 ghiJ_KLmno  1 P   1     2.4811     4.6887    7 O    0 0 0
 pqrS_TLxyz  1 L   1     2.4872     4.7000    7 O    0 0 0
 ... 
 (the same scheme)       

我想制作一个遍历这些文件的 bash 脚本，例如：

for {i = 7, 8, 14, 16} in d_Ca-1_O_i.dat 

并将每个文件转换为这种格式：

 A.BC     2.4733     #  0 0 0
 J.KL     2.4811     #  0 0 0
 S.TL     2.4872     #  0 0 0
 ... 
 (the same scheme)       

在每一行中：

1) 第一列：我们减少开头的相同位，结尾的相同位

2) 第一列：将_ 替换为.

2) 删除第 2、3、4、6、7、8 列

4) 在第 9 列的每一行开头添加一个#

非常感谢您的帮助

Answer 1

假设您的输入是制表符分隔的，这里是一个 GNU Awk 脚本：

script.awk：

BEGIN { OFS=FS="\t"}
      { strange = gensub(/^.*(.)_(..).*$/,"\\1.\\2","",$1)
        print strange, $5, "#" $9 }

在 bash 的 for 循环中像这样使用它：awk -f script.awk yourfile

例如类似：

for i in 7 8 14 16 
do 
  awk -f script.awk "d_Ca-1_O_${i}.dat"
done

对于第一个字段的转换，脚本在下划线的左边取一个字符，在右边取两个字符。下划线转换为点，字段一中的所有其他字符都将被丢弃。