在没有 Shiny 服务器的 Docker 中运行 Shinyapp

Question

我正在尝试在 Docker 中运行一个闪亮的应用程序，我看到了两种方法：

1) 在 Docker 中运行 Shiny 服务器，然后在该服务器上运行 Shiny 应用程序。它可以工作，但我仍在努力让用户目录从 Shiny 应用程序中可见（使用 -v 参数进行简单安装没有帮助）。

2) 使用命令R -e "shiny::runApp('/srv/shiny-server/')" 直接在 Docker 上运行 Shiny。在这种情况下，它几乎可以工作，但我收到了这个错误：

shiny::runApp('/srv/shiny-server/', launch.browser = T)
Loading required package: shiny
Listening on http://127.0.0.1:4637
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: www-browser: not found
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: links2: not found
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: elinks: not found
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: links: not found
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: lynx: not found
/usr/bin/xdg-open: 844: /usr/bin/xdg-open: w3m: not found
xdg-open: no method available for opening 'http://127.0.0.1:4637'

我尝试安装浏览器（将apt-get install -y firefox 添加到我的 Dockerfile 中）但它仍​​然无法正常工作。

我找不到任何关于如何在没有 Shiny Server 的情况下在 Docker 上运行 Shiny 应用程序的教程/示例。因此，我将不胜感激！

Answer 1

在您的第二种方法中，R 进程尝试在 docker 容器内打开浏览器，因为它认为它是交互式使用的。一个简单的改变方法是使用Rscript -e ... 而不是R -e ...。或者，您可以将 launch.browser 参数设置为 FALSE。

此外，您应该将闪亮的应用程序绑定到任何 IP 地址上的固定端口，并在启动 docker 容器时将该端口发布到主机。您可以使用参数port = 3838 和host = "0.0.0.0" 来做到这一点。

除了通过参数指定这些东西，您还可以通过添加来使用 R 的选项机制

options(shiny.port = 3838, shiny.host = "0.0.0.0", shiny.launch.browser = FALSE) 

到Rprofile.site。