MatLab 中的网格图阈值

Question

我正在使用一种算法来确定 MATLAB 中细胞核图像分析的阈值。该算法测量核内的所有像素强度并计算一个值，该值用作区分背景噪声和前景的截止值。我知道如何将此值应用于核图像以查看截止有什么影响，但我想将阈值应用于网格图。碰巧有人知道如何做到这一点，我还不能发布图像，但我添加了图像分析的示例代码

example image of nucleus

% First I load image
i = imread('nucleus.tif')
% I calculate the value of the threshold using my algorithm using my function
ci99 = getCI99('nucleus.tif')
% say for example that the calculated value is 100. I would apply this threshold to the image of the nucleus with the following command
imshow(picture , [ 100, inf]) % The resulting image only shows pixels at and above the calculated threshold.

我使用下面的代码来绘制一个原子核的网格图

% Mesh Plot
I=imread('nucleus.tif');
[x,y]=size(I);
X=1:x;
Y=1:y;
[xx,yy]=meshgrid(Y,X);
i=im2double(I);
figure;mesh(xx,yy,i);
colorbar
figure;imshow(i)

我正在尝试将截止值应用于网格图，类似于我将阈值应用于原始图像的方式。

非常感谢任何帮助。

谢谢

Answer 1

查看Matlab clim function

你应该能够做到这一点：

clim([min_threshold max_threshold]);

您还可以通过按住轴手柄（有点像指针）来访问特定的图

fig1 = figure;
ax1  = mesh(xx,yy,i);
colorbar;

fig2 = figure;
ax2  = imshow(i);

set(ax1, 'clim', [100, inf]);

握住轴手柄可让您随时在任何绘图上设置参数，而不仅仅是处理您正在处理的最后一个。

最后一点：尝试使用图像功能而不是 imshow。不完全一样，但你可能会发现你根本不需要使用图像处理工具箱。