【问题标题】:Lesion load calculation using matlab使用matlab计算病变负荷
【发布时间】:2016-02-06 01:01:31
【问题描述】:

我拥有多发性硬化 (MS) 病变的多序列(T1 加权、T2 加权)磁共振图像以及带注释(标签)的图像。在分割之前,我想知道如何使用 MATLAB 的任何序列来计算 病变负荷,或者是否有任何可用的工具用于此目的。很高兴得到一些帮助或指导。

总病变负荷 (TLL) 是根据病变的分割估算的,在这种情况下,由单独的标记掩码给出(标签或注释单独提供) 我有未标记的多序列图像(比如说 T1 加权)以及图像的标签。但是,我想知道使用标签(注释)作为参考的未标记图像中病变的百分比是多少。

【问题讨论】:

  • 您能否提供更多有关您拥有的数据的信息以及“病变负荷”的定义
  • @Suever 我更新了我的问题
  • 你有一些图片可以向我们展示你想要做什么吗?
  • 所以您...只想知道标记的像素百分比是多少?还是别的什么?
  • @nkjt 是的。我想知道有多少百分比的像素被标记,这当然与病变的总量相同

标签: matlab image-processing image-segmentation


【解决方案1】:

使用 SPM 工具箱尝试 Mohamed Seghier 的自动病变识别扩展,更多信息来自 http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ext/

【讨论】:

  • 谢谢!我已经检查过了。它只识别病变,不提供总病变负荷(病变百分比)
  • 它会为你提供一个体积,你可以用你的面具计算百分比吗?我从来没有听说过这个 TLL。
  • 一篇在线论文使用了带有 TOADS-CRUISE 插件的 FreeSurfer 工具。术语负荷用于定义病变体积变化?
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