在 Google Colab 上使用 AddMoleculeColumnToFrame 时出现问题答案

【问题标题】：Problem using AddMoleculeColumnToFrame on Google Colab在 Google Colab 上使用 AddMoleculeColumnToFrame 时出现问题
【发布时间】：2019-11-01 09:04:03
【问题描述】：

我一直在 Google Colab 上使用 AddMoleculeColumnToFrame 没有问题。大约 1 个月没有使用它后，我才发现它停止工作，即图像没有显示在数据框中（见下文）。

有什么想法吗？最可能的解释是 Google Colab 发生了一些变化。但是否也可能是新版本的 Pandas 导致了问题？

这是笔记本的链接和屏幕截图。

https://colab.research.google.com/drive/1nQPmdEbYQgVsFr7c44yRd3wpXPEsJar3

【问题讨论】：

标签： pandas google-colaboratory rdkit

【解决方案1】：

似乎这是0.25.0以上所有pandas版本的问题，所以我想现在最简单的解决方法是降级pandas。或者你可以使用这个似乎对我有用的方法：

from IPython.display import HTML
HTML(df.to_html())

https://colab.research.google.com/drive/1eP8VZdr61DIoYXRz3PfwmVeG71GRzsRG

我不太清楚为什么，但这似乎也有效：

def display_mol(x):
    if isinstance(x, Mol):
        return x
    return x

df.style.format(display_mol)

截图：

【讨论】：

笔记本不适合我：我得到“名称 'Mol' 未定义”。我也无法让 HTML(df.to_html()) 工作。能给我举个例子吗？最后，我尝试降级 pandas，但即使您重新定义 sys.path 顺序，它似乎总是使用相同的版本。任何帮助表示赞赏
第一个问题我忘了添加导入：from rdkit.Chem import Mol。至于 HTML 方法，这对我来说似乎很好用，不过我会再看一下。
HTML(df.to_html()) 现在可以工作了。我不知道为什么它以前不起作用。非常感谢你！我真的很感激帮助。顺便说一句，您对如何降级熊猫有任何想法吗？我尝试使用 pip 和 conda-forge 安装 0.24.2 但导入始终使用 /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/pandas/__init__.py ，即使它稍后出现路径
我曾尝试在 colab 中降级 pandas，但我意识到这并不是特别容易。虽然我最终确实让它工作了，但它并不是特别直观。在一个新的笔记本中我做了：!pip install pandas==0.24.2 然后重新启动运行时，然后我以与以前相同的方式下载 rdkit，再次重新启动运行时，现在 pandas 似乎停留在 0.24.2 版本。在此之后，我使用了与上面相同的代码，并且图像按预期显示。
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