如何在 Macos 上为 clang 安装 boost-mpi 及其依赖项？答案

【问题标题】：How do I install boost-mpi and it's dependecies for clang on Mac OS?如何在 Macos 上为 clang 安装 boost-mpi 及其依赖项？
【发布时间】：2020-09-07 07:58:26
【问题描述】：

我一直试图在 MAC OS 上为 clang 安装 boost-mpi，但我失败了。谁能帮我？我试过了：
brew install open-mpi
brew install boost
brew install boost-mpi
但我收到了这个 CMake 错误：

CMake Warning at /usr/local/lib/cmake/boost_mpi-1.72.0/libboost_mpi-variant-shared.cmake:64 (message):
  Target Boost::mpi already has an imported location
  '/usr/local/lib/libboost_mpi-mt.dylib', which will be overwritten with
  '/usr/local/lib/libboost_mpi.dylib'

我尝试运行 MPI Hello world 程序广告得到了这个错误输出：

Assertion failed: (_check_result == MPI_SUCCESS), function recv_impl, file /usr/local/include/boost/mpi/communicator.hpp, line 1400.
[Deniss-MacBook-Pro:83252] *** Process received signal ***
[Deniss-MacBook-Pro:83252] Signal: Abort trap: 6 (6)
[Deniss-MacBook-Pro:83252] Signal code:  (0)
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 0] 0   libsystem_platform.dylib            0x00007fff6a5b95fd _sigtramp + 29
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 1] 0   ???                                 0x0000000000000180 0x0 + 384
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 2] 0   libsystem_c.dylib                   0x00007fff6a48f808 abort + 120
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 3] 0   libsystem_c.dylib                   0x00007fff6a48eac6 err + 0
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 4] 0   MPI                                 0x0000000100616af6 _ZNK5boost3mpi12communicator9recv_implIiEENS0_6statusEiiRT_N4mpl_5bool_ILb1EEE + 214
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 5] 0   MPI                                 0x00000001006167f0 _ZNK5boost3mpi12communicator4recvIiEENS0_6statusEiiRT_ + 48
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 6] 0   MPI                                 0x00000001006166f2 main + 114
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 7] 0   libdyld.dylib                       0x00007fff6a3c0cc9 start + 1
[Deniss-MacBook-Pro:83252] [ 8] 0   ???                                 0x0000000000000001 0x0 + 1
[Deniss-MacBook-Pro:83252] *** End of error message ***

有谁知道如何解决这个问题并让 Hello World 程序正常运行？
UPD 1：我设法在我的 CMakeLists.txt 中使用 set(Boost_USE_MULTITHREADED TRUE) 修复了 CMake 警告，但程序仍然崩溃。我认为这是 Mac OS Catalina 的一个问题：它要求在每次运行时为已编译程序接收网络连接的权限。有谁知道如何处理这个问题？
UPD 2：我尝试关闭防火墙，它没有要求接受传入连接，但仍然失败并出现同样的错误。

【问题讨论】：

您是否检查过this question 与您收到的类似警告消息？
它删除了 CMake 警告，但程序仍然崩溃
如果你想坚持clang，那么你的答案可能没问题，你可以跳过这条评论的其余部分。如果您想改用gcc，但又害怕为macOS 构建它，您可以使用这个：owsiak.org/… 和这个：owsiak.org/…
@Oo.oO 为什么将gcc 与mpi 一起使用比clang 更好？我是 MPI 的新手，如果这是一个愚蠢的问题，我很抱歉。
@DenisIvanenko 我并不认为它更好。但我很确定在 HPC 机器上安装 OpenMPI 和 gcc 更为常见。因此，最终，当您决定将您的计算带入 HPC 世界时，会发现一切都基于那里的 gcc。这就是为什么我更喜欢在我的 macOS 上使用基于 gcc 的代码 - 当涉及到基于 MPI 的代码时。

标签： c++ boost mpi clion macos-catalina

【解决方案1】：

我设法解决了这一切。实际上，我的错误由很多东西组成。首先，正如我在this question 中发现的，set(Boost_USE_MULTITHREADED TRUE) 有助于删除 CMake 警告。但是程序警告的问题是因为 CLion 没有使用mpirun 运行 mpi 程序。但是，mpirun 程序运行时还有其他警告。可以使用export PMIX_MCA_gds=hash 修复此警告。我找到了这个解决方案here。

【讨论】：