循环C编译并通过BASH运行答案

【问题标题】：Looping C compilation and running through BASH循环C编译并通过BASH运行
【发布时间】：2016-01-28 15:49:54
【问题描述】：

我正在尝试编译和运行 C 代码，同时通过 bash 循环输入文件。这是我用来自动化它的 bash 脚本的代码。

 ~!/bin/bash
 file=1
 outfile='outputnumber'$file
 readsfile='readsfilename'$file'.txt'
 compilefile=compiler$file'.o'
 gcc -lgsl -lgslcblas -std=c99 filewithccode.c -o $compilefile
 echo "Compilation over"
./$compilefile  $outfile $readsfile

所以我基本上想要做的是编译filewithcode.c，以便可执行文件存储为compiler1，它将outputnumber1和readsfilename1.txt作为输入。我想这样做的原因是，我可以在“文件”上循环它并为多个文件（我有 45 个）自动化它并自动执行。但我得到了错误：

Segmentation fault      (core dumped) ./$compilefile $outfile $readsfile

我试图为编译后的文件使用不同的名称，因为我试图在服务器上并行运行它们，我不确定使用相同的输出名称进行编译是否会导致问题。

有什么建议吗？我知道"./$" 可能会导致该错误，因为 BASH 正在回显“编译结束”。

【问题讨论】：

I am trying to use different names for the compiled file because I am trying to run them parallelly on a server and I am not sure if compiling with the same output name will cause an issue. 不，不会。编译一次并根据需要经常启动它，如果需要，每个都使用不同的命令行参数。 SIGSEGV 的原因很可能是在 C 代码中，您没有向我们展示。
为什么不回显 ./$compilefile $outfile $readsfile 以确保一切运行正常，也可能是可执行文件本身的问题，您是否遇到过手动运行的问题？
同意段错误来自你的 C。仅仅因为它编译并不意味着它不会出现段错误，特别是如果你使用 gcc 编译。您是否尝试过手动编译并在循环和 bash 脚本之外运行进行测试？
为什么要在可执行输出文件的名称后面附加.o 扩展名？该扩展名通常用于目标文件，而不是可执行文件。
@tadamhicks 请解释“特别是如果你使用 gcc 编译”

标签： c linux bash parallel-processing

【解决方案1】：

您的最后一行，因为它只是放在一行上的变量，可能会导致您的脚本无法正确解释它。您可以尝试将其变成一个字符串，然后对该字符串使用 exec 命令。例如：

comm="./""$compilefile $outfile $readsfile"
exec $comm

这为我在过去引用变量时节省了很多语法问题。

【讨论】：