【发布时间】:2020-02-05 08:56:42
【问题描述】:
我试图在 Matlab 中基于相异矩阵 X 制作树状图。我使用 Y=squareform(X) 将其转换为链接可以接受的格式。然后我得到以下向量:
Y = [0 0 0 0 1.4476 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7525 0 0 0 0 0 1.9634 11.3676 0 0 0 2.1579 14.4957 0 0 0 0 0 0 0 0 0];
我尝试使用完整的链接绘制树状图:
dendrogram(linkage(Y,'complete'))
但是,当我在 R 中使用相异矩阵 X 时(也使用完整的链接方法:dend <- as.dendrogram(hclust(as.dist(X)))),我得到一个完全不同的树状图:
与 matlab 相比,使用 R 制作的树状图对输入数据更有意义(因为它符合所用数据的预期分组)。
知道为什么它们如此不同吗?有没有办法在matlab中重现R树状图?
编辑:X 矩阵:
0 0 0 0 0 1.4476 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 1.7525
0 0 0 0 0 0 0 0 1.9634
0 0 0 0 11.3676 0 0 0 2.1579
0 0 0 11.3676 0 14.4957 0 0 0
1.4476 0 0 0 14.4957 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 1.7525 1.9634 2.1579 0 0 0 0 0
【问题讨论】:
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能否分享一下用于获取第二个情节的 R 代码?
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...给我们输入数据
X来解释为什么 R 图“更有意义” -
已添加R代码。只需在 Matlab 中使用 squareform(Y) 即可获取 X 矩阵,但我也可以将其添加到帖子中
标签: r matlab linkage dendrogram