在 R 中从具有边缘属性的邻接列表创建 igraph 对象答案

【问题标题】：Create an igraph object from an adjacency list with edge attributes in R在 R 中从具有边缘属性的邻接列表创建 igraph 对象
【发布时间】：2014-05-28 19:45:49
【问题描述】：

我有一个 4 列的邻接矩阵。前 2 列是我想成为 igraph 对象中的顶点的源节点和目标节点。我可以使用下面的代码来实现这一点。

al <- data.frame(sourceNode=c('a', 'a', 'b', 'c'), 
             consumerNode=c('b', 'c', 'c', 'a'), 
             edgeAtt1=c('highway', 'road', 'road', 'path'),
             edgeAtt2=c('1999', '2010', '2014', '1999'))

require('igraph')
g <- graph.edgelist(as.matrix(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]))

但是，当我创建这个 igraph 对象时，我想做的是包含来自 al 的第 3 列和第 4 列作为边缘属性。

一些函数 functionThatINeed 让我可以做这样的事情：

g <- functionThatINeed(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]), edgeAttributes=al[,c('edgeAtt1', 'edgeAtt2')])

【问题讨论】：

标签： r igraph

【解决方案1】：

创建图表时不能这样做，但可以在使用edge.attributes() 之后立即进行

require('igraph')
g <- graph.edgelist(as.matrix(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]))
edge.attributes(g) <- al[,c('edgeAtt1', 'edgeAtt2')]

如果你真的想，你可以创建你自己的函数

graph.edgelist.attributes <- function(et, at=NULL, directed=F) {
    g <- graph.edgelist(el, directed)
    edge.attributes(g) <- at
    g
}

【讨论】：

【解决方案2】：

我想我真的找到了答案。 igraph 包中的graph.data.frame 允许您从一个提供边缘属性的 edgelist 数据帧和提供节点属性的第二个数据帧创建一个 igraph 对象。

http://www.inside-r.org/packages/cran/igraph/docs/graph.data.frame

【讨论】：