加载 gdata 包时如何修复 Perl 警告消息？

Question

我更新了Strawberry Perl 64-bit 5.30.2001 和gdata 包。现在，在加载 library(gdata) 时，我总是收到此警告消息，似乎与 Perl 相关。

suppressPackageStartupMessages(library(gdata))
# Warning messages:
#   1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2
#   2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2

不过，read.xls这个我需要的功能，似乎运行的不错，只是每次使用都会重复警告。

read.xls("http://file-examples-com.github.io/uploads/2017/02/file_example_XLS_10.xls")
# trying URL 'http://file-examples-com.github.io/uploads/2017/02/file_example_XLS_10.xls'
# Content type 'application/vnd.ms-excel' length 8704 bytes
# downloaded 8704 bytes

#   X0 First.Name Last.Name Gender       Country Age       Date   Id
# 1  1      Dulce     Abril Female United States  32 15/10/2017 1562
# 2  2       Mara Hashimoto Female Great Britain  25 16/08/2016 1582
# 3  3     Philip      Gent   Male        France  36 21/05/2015 2587
# 4  4   Kathleen    Hanner Female United States  25 15/10/2017 3549
# 5  5    Nereida   Magwood Female United States  58 16/08/2016 2468
# 6  6     Gaston     Brumm   Male United States  24 21/05/2015 2554
# 7  7       Etta      Hurn Female Great Britain  56 15/10/2017 3598
# 8  8    Earlean    Melgar Female United States  27 16/08/2016 2456
# 9  9   Vincenza   Weiland Female United States  40 21/05/2015 6548
# Warning messages:
#   1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2
#   2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2

我不确定如何处理此警告，因为它对我没有任何意义，我可能会忽略它并在其周围加上 suppressWarnings()。

但是，有人知道解决此问题的方法吗？我通过谷歌搜索找不到任何东西，不知道从哪里开始以及实际出了什么问题。

> sessionInfo()
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] gdata_2.18.0

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.0.2 tools_4.0.2    gtools_3.8.2  

Answer 1

我在新安装的 R、gdata 和 Strawberry Perl 版本中遇到了同样的问题。我终于找到了this answer 来解决一个不同（但相关）的问题。在那里调整建议，我在 elevated 命令提示符上运行了以下命令：

FTYPE perl=C:\Strawberry\perl\bin\perl.exe %1 %*

这为我解决了这个问题——但是：我不确定像这样设置 FTYPE 是否会产生任何不需要的副作用。所以要小心。

---

更新：上面的命令确实为我抑制了警告“ftype perl' has status 2”，但gdata仍然有问题：

gdata：无法加载 read.xls() 所需的 perl 库 gdata：支持“XLSX”（Excel 2007+）文件。

gdata：运行函数“installXLSXsupport()” gdata：自动下载和安装 perl gdata：支持 Excel XLS 和 XLSX 格式所需的库。

但是，installXLSXsupport() 失败并显示不特定的错误消息。

然后我跑了

Sys.which("perl")
                              perl 
"C:\\rtools40\\usr\\bin\\perl.exe" 

并意识到来自 RTools 的 Perl 版本优先于我的 Strawberry Perl 安装 - 显然 gdata 不“喜欢”那个 Perl 版本。

因此，我决定通过更改我的 .Renviron 文件 (usethis::edit_r_environ())，让 Strawberry Perl 优先于 RTools：

PATH="${RTOOLS40_HOME}\usr\bin;${PATH}" # old
PATH="${PATH};${RTOOLS40_HOME}\usr\bin" # new

同样，我不完全确定 this 可能会产生什么后果，但它为我修复了 gdata。 也许单独调整PATH 也可以解决问题（没有我首先制作的ftype 特技），但我无法再测试了。

我的建议：

1. 先调整PATH。
2. 如果gdata 仍然抱怨ftype，请设置ftype。