python中的压缩后缀数组答案

【问题标题】：compressed suffix array in pythonpython中的压缩后缀数组
【发布时间】：2018-03-25 17:01:25
【问题描述】：

python中是否有关于压缩后缀数组Psi的实现？我实际上了解后缀数组是如何工作的，并让 Psi 给定一个后缀数组，但是有没有办法通过使用 python 来获得它？我正在搜索是否有一些库或另一个实现之王，但没有遇到可以在 python 中使用的东西。这是一个例子：

offset     0  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10 11 12 13 14 15 #indexes
Text       a  b  b  a  a  b  b  a  a  a  b  a  b  b  b  $ 
SA         15 7  8  3  9  4  0 11 14  6  2 10 13  5  1 12 #suffix array
Psi        $  2  4  5 11 13 14 15  0  1  3  7  8  9 10 12 #Psi

Psi 数组是通过查找索引获得的。例如，对于 Psi 数组中的索引 1，我们必须在 SA 中的索引 1 中查找值（它是 7）现在我们将 1 添加到值 (7+1) 并查看与该值 8 关联的索引（在本例中为 2） .对于 Psi 中的索引 2，我们在 SA (8) 中的索引 2 中查找值并添加 1 (8+1)，然后查看与该值 9 相关联的索引，结果为 4，依此类推。

【问题讨论】：

标签： python suffix-array

【解决方案1】：

真的不需要图书馆：

Text = "abbaabbaaababbb"

SA = sorted(list(range(0,len(Text)+1)), key=lambda i:Text[i:])

SAINV = [None]*(len(SA)+1)
for i in range(0,len(SA)):
    SAINV[SA[i]]=i

Psi = [SAINV[pos+1] for pos in SA]

print SA
print SAINV
print Psi

产量：

[15, 7, 8, 3, 9, 4, 0, 11, 14, 6, 2, 10, 13, 5, 1, 12]
[6, 14, 10, 3, 5, 13, 9, 1, 2, 4, 11, 7, 15, 12, 8, 0, None]
[None, 2, 4, 5, 11, 13, 14, 15, 0, 1, 3, 7, 8, 9, 10, 12]

【讨论】：