【发布时间】:2019-07-19 09:23:02
【问题描述】:
我有一个 Seurat R 对象。我只想选择与特定样本对应的数据。因此,我只想获取包含特定字符的行名。我的行名差异示例:CTAAGCTT-1 和 CGTAAAT-2。我想根据 1 和 2 进行区分。下面的代码显示了我已经尝试过的内容。但它只返回总行数。不是有多少行与字符匹配。
length <- length(rownames(seuratObject@meta.data) %in% "1")
或
length <- length(grepl("-1",rownames(seuratObj@meta.data)))
Idents(seuratObject, cells = 1:length)
感谢您的任何意见。
【问题讨论】:
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您可能想使用
grepl或grep、length(grep("1$", rownames(seuratObject@meta.data)))或sum(grepl("1$", rownames(seuratObject@meta.data)))
标签: r pattern-matching row seurat