使用子进程从 Python 运行 PDAL bash 命令的问题 [重复]答案

【问题标题】：Issue using subprocess to run a PDAL bash command from Python [duplicate]使用子进程从 Python 运行 PDAL bash 命令的问题 [重复]
【发布时间】：2019-01-27 13:29:56
【问题描述】：

问题：

我无法使用 subprocess 从 Python 运行 pdal bash 命令。

这里是代码

基于Running Bash commands in Python：

import os, subprocess

input = '/path/to/file.ply'
output = '/path/to/statfile.json'
if not os.path.isfile(output):
    open(output, 'a').close()

bashcmd = ("pdal info --boundary "
           +input
           +" > "
           +output
           )

print("Bash command is:\n{}\n".format(bashcmd))

process = subprocess.Popen(bashcommand.split(),
                           stdout=subprocess.PIPE,
                           shell=True)
    output, error = process.communicate()
    print("Output:\n{}\n".format(output))
    print("Error:\n{}\n".format(error))

这在 Python 控制台中给了我这个输出：

Bash command is:
pdal info --boundary /path/to/file.ply > /path/to/statfile.json

Output:
Usage:
  pdal <options>
  pdal <command> <command options>
  --command        The PDAL command
  --debug          Sets the output level to 3 (option deprecated)
  --verbose, -v    Sets the output level (0-8)
  --drivers        List available drivers
  --help, -h       Display help text
  --list-commands  List available commands
  --version        Show program version
  --options        Show options for specified driver (or 'all')
  --log            Log filename (accepts stderr, stdout, stdlog, devnull as
      special cases)
  --logtiming      Turn on timing for log messages

The following commands are available:
  - delta
  - diff
  - fauxplugin
  - ground
  - hausdorff
  - info
  - merge
  - pcl
  - pipeline
  - random
  - smooth
  - sort
  - split
  - tindex
  - translate

See http://pdal.io/apps/ for more detail

Error:
None

它看起来好像只在调用“pdal”之后停止读取命令的参数，这会打印此帮助消息。

如果我复制第一次打印的输出并将其粘贴到 bash 终端，它会正常工作，并为我提供包含所需元数据的输出文件。但是在 Python 中没有创建输出文件。

问题：

我想知道为什么（例如，重定向有什么问题，或者计算本身通常需要大约 20 秒？），以及如何从 Python 执行此命令？

This 没有为当前问题提供足够明确的答案。

【问题讨论】：

标签： python bash subprocess pdal

【解决方案1】：

这里有多个错误。

您使用的是未定义的变量bashCommand，而不是您在上面定义的变量bashcmd。
您正在使用 shell 重定向将输出混合到 Python 文件句柄。
您没有捕获进程的stderr。（我会模糊地假设你不需要标准错误。）
如果您使用shell=True 运行该命令，则不应使用split()。

更广泛地说，您可能应该避免使用shell=True，并让 Python 通过将输出连接到您打开的文件来为您处理重定向；而在现代，如果你可以使用subprocess.run() 或subprocess.check_call() 或朋友，你真的不应该使用subprocess.Popen()。

import subprocess

input = '/path/to/file.ply'
output = '/path/to/statfile.json'

with open(output, 'a') as handle:
    bashcmd = ['pdal', 'info', '--boundary', input]

    #print("Bash command is:\n{}\n".format(bashcmd))

    result = subprocess.run(bashcmd, stdout=handle, stderr=subprocess.PIPE)

    # No can do because output goes straight to the file now
    ##print("Output:\n{}\n".format(output))
    #print("Error:\n{}\n".format(result.stdout))

【讨论】：