【问题标题】:Multiprocessing on pandas DataFramepandas DataFrame 上的多处理
【发布时间】:2020-09-14 00:40:45
【问题描述】:

我正在对 Dataframe 列应用一个函数,但我想让它更快,因为该函数在串行完成时需要大量处理时间。

df[df['codes']=='None']['q'][:1].apply(lambda x: clf(x,candidate_labels))

单行只需要 2.52 secs 运行,但是当使用多处理运行下面的代码时,它需要更长的时间 51.61 secs 并且我有大约 2500 rows 用于处理,所以它需要很多时间来运行函数。我希望至少能加快速度20%

import multiprocessing
import pandas as pd
import numpy as np

def clf(x):
    ...
    return list
def _apply_df(args):
    df, func, kwargs = args
    return df.apply(func, **kwargs)

def apply_by_multiprocessing(df, func, **kwargs):
    workers = kwargs.pop('workers')
    pool = multiprocessing.Pool(processes=workers)
    result = pool.map(_apply_df, [(d, func, kwargs)
            for d in np.array_split(df, workers)])
    pool.close()
    return pd.concat(list(result))
    
if __name__ == '__main__':
    tart_time = time.time()
    res=apply_by_multiprocessing(df[df['codes']=='None']['q'][:1],clf, workers=4)  
    print(res)
    print("--- %s seconds ---" % (time.time() - start_time))
    ## run by 4 processors

我也为多处理尝试了不同的迭代,但似乎都没有加快流程,因为它们减慢了我的代码。

from pandarallel import pandarallel
import time
pandarallel.initialize(progress_bar=True)

start_time = time.time()
categories = df[df['codes']=='None']['q'][:10].parallel_apply(lambda x: clf(x,candidate_labels))
print("--- %s seconds ---" % (time.time() - start_time))

另一个实验:

import multiprocessing as mp

def clf:
    ...
    return list

if __name__ == '__main__':
    p = mp.Pool(processes=8)
    pool_results = p.map(clf, df[df['codes']=='None']['q'][:1])
    p.close()
    p.join()

【问题讨论】:

  • clf 在做什么?也许有矢量化的替代方案......此外,多进程需要时间来配置,并且它在规模上弥补了它,但如果没有明确的方法将函数拆分为线程,那么您将获得零时间并花更多时间配置调用
  • @RichieV 感谢您的回复,所以clf 实际上正在运行一个用于文本分类的预训练模型,我将其应用于 Dataframe 的每一行。每一行都是一个句子,需要分类到特定的主题中。
  • 您使用的是哪种型号?我知道 sklearn 嵌入了多进程作为选项
  • 否则,有没有办法将多行传递给您的模型?在创建多进程之前我会调查一下
  • @RichieV 我没有使用 sklearn 中的任何东西。它是 HuggingFace 的零样本文本分类模型。函数clf 只是在做candidate_labels=['a','b',..] cat=classifier(seq,candidate_labels) return cat

标签: pandas multithreading dataframe parallel-processing multiprocessing


【解决方案1】:

也许你可以使用这个: https://github.com/xieqihui/pandas-multiprocess

pip install pandas-multiprocess
from pandas_multiprocess import multi_process


args = {'workers': 4}
result = multi_process(func=clf, data=df, num_process=8, **args)

【讨论】:

  • 我刚试过,单行大约需要17 secs。仍然比.apply 函数慢,并且不符合我预期的多处理结果。
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