【发布时间】:2010-09-14 08:17:24
【问题描述】:
我正在尝试解析一个大文件 (> 2GB) 的结构化标记数据,但内存不足。对于这种情况,这是 XML 解析类的最佳方式。请详细说明。
【问题讨论】:
我正在尝试解析一个大文件 (> 2GB) 的结构化标记数据,但内存不足。对于这种情况,这是 XML 解析类的最佳方式。请详细说明。
【问题讨论】:
查看iterparse() 函数。可以在here 找到如何使用它来解析非常大的文档的说明。
【讨论】:
大多数 DOM 库(如 ElementTree)在核心中构建整个文档模型。传统上,当您的模型太大而无法立即放入内存时,您需要使用更面向流的解析器,例如 xml.sax。
这通常比您预期的要难,尤其是在用于高阶操作(例如同时处理整个 DOM)时。
你的xml文档有没有可能很简单
<entries>
<entry>...</entry>
<entry>...</entry>
</entries>
这将允许您以对 ElementTree 更友好的方式处理数据子集?
【讨论】:
我见过的唯一可以处理这种事情的 API 是 pulldom:
http://docs.python.org/library/xml.dom.pulldom.html
Pulldom 使用 SAX API 构建部分 DOM 节点;通过将特定的子树作为一个组拉入,然后在完成后丢弃它们,您可以获得 SAX 的内存效率和 DOM 的合理使用。
这是一个不完整的 API;当我使用它时,我必须对其进行修改以使其完全可用,但它可以作为基础。我不再使用它,所以我不记得我必须添加什么;只是提前警告。
很慢。
XML 对于处理大型数据集来说是一种非常糟糕的格式。如果您对源数据有任何控制权,并且如果它对数据集有意义,那么最好将数据分成更小的块,以便完全解析到内存中。
另一种选择是使用 SAX API,但直接用它们做任何不重要的事情都会很痛苦。
【讨论】:
是的,十年后,已经有许多处理大文件的新解决方案。下面我为大家推荐一款。
例如文件test.xml的内容如下
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<breakfast_menu>
<food>
<name>Strawberry Belgian Waffles</name>
<price>$7.95</price>
<description>
Light Belgian waffles covered with strawberries and whipped cream
</description>
<calories>900</calories>
</food>
<food>
<name>Berry-Berry Belgian Waffles</name>
<price>$8.95</price>
<description>
Belgian waffles covered with assorted fresh berries and whipped cream
</description>
<calories>900</calories>
</food>
......
</breakfast_menu>
使用SimplifiedDoc的解决方案如下:
from simplified_scrapy import SimplifiedDoc, utils
doc = SimplifiedDoc()
doc.loadFile('test.xml', lineByline=True)
for food in doc.getIterable('food'):
print (food.children.text)
结果:
['Strawberry Belgian Waffles', '$7.95', 'Light Belgian waffles covered with strawberries and whipped cream', '900']
...
【讨论】:
正如其他回答者所说,ElementTree 是一个 DOM 解析器,尽管它有 iterparse() 方法。
为了减少内存占用,我使用了真正的 SAX 解析器。 Here 是我用于解决方案的链接。 Here's官方文档。这是我的 XML:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<metadata>
<entity storageTableName="table7113" tableName="TableBusinessName">
<attribute storageFieldName="field7114" fieldName="BusinessName1" />
<attribute storageFieldName="field7115" fieldName="BusinessName2" />
. . .
</entity>
. . .
</metadata>
代码如下:
import xml.sax
class ModelNameHandler(xml.sax.ContentHandler):
ENTITY_TAG = "entity"
STORAGE_TABLE_NAME_ATTR = "storageTableName"
TABLE_NAME_ATTR = "tableName"
ATTRIBUTE_TAG = "attribute"
STORAGE_FIELD_NAME_ATTR = "storageFieldName"
FIELD_NAME_ATTR = "fieldName"
def __init__(self):
self.entity_code = None
self.entity_names = {}
self.attr_names = {}
def startElement(self, tag, attributes):
if tag == self.ENTITY_TAG:
self.entity_code = attributes[self.STORAGE_TABLE_NAME_ATTR]
entity_name = attributes[self.TABLE_NAME_ATTR]
self.entity_names[self.entity_code] = entity_name
elif tag == self.ATTRIBUTE_TAG:
attr_code = attributes[self.STORAGE_FIELD_NAME_ATTR]
key = self.entity_code + "." + attr_code
attr_name = attributes[self.FIELD_NAME_ATTR]
self.attr_names[key] = attr_name
def get_model_names(file):
parser = xml.sax.make_parser()
parser.setFeature(xml.sax.handler.feature_namespaces, 0)
handler = ModelNameHandler()
parser.setContentHandler(handler)
parser.parse(file)
return handler.entity_names, handler.attr_names
运行速度足够快。
以防万一,再详细一点:
import my_package as p
if __name__ == "__main__":
with open('<my_path>/<my_file>.xml', 'r', encoding='utf_8') as file:
entity_names, attr_names = p.get_model_names(file)
【讨论】: