为 qsub 自动创建不同进程名称的最佳方法

Question

我在高性能计算机上运行我的程序，通常使用不同的参数作为输入。这些参数通过参数文件提供给程序，即 qsub 文件看起来像

#!/bin/bash
#PBS -N <job-name>
#PBS -A <name>
#PBS -l select=1:ncpus=20:mpiprocs=20
#PBS -l walltime=80:00:00
#PBS -M <mail-address>
#PBS -m bea 
module load foss

cd $PBS_O_WORKDIR

mpirun main parameters.prm

# Append the job statistics to the std out file
qstat -f $PBS_JOBID

现在我通常或多或少地同时运行同一个程序多次，使用不同的parameter.prm-files。然而，它们都以相同的名称出现在作业列表中，使得列表中的作业与使用的参数之间的关联变得困难（并非不可能）。
有没有办法根据使用的输入参数（最好来自main）动态更改作业列表中的程序名称？或者是否有另一种方法可以更改作业名称，而无需每次运行时都编辑作业文件

qsub job_script.pbs

?
创建一个从参数文件中读取数据，然后依次创建作业脚本并运行它的 shell 脚本是一种解决方案吗？还是有更简单的方法？

Answer 1

只需在命令行上使用-N 选项：

qsub -N job1 job_script.pbs

然后您可以使用 for 循环遍历 *.prm 文件：

for prm in *.prm
do
  prmbase=$(basename $prm .prm)
  qsub -N $prmbase main $prm
done

这将通过参数文件名命名每个作业，不带.prm 后缀。