读取用 Python Paramiko SFTPClient.open 方法打开的文件很慢

Question

我正在尝试远程读取 netcdf 文件。
我使用 Paramiko 包来读取我的文件，如下所示：

import paramiko
from netCDF4 import Dataset

client = paramiko.SSHClient()
client.set_missing_host_key_policy(paramiko.AutoAddPolicy())
client.connect(hostname=’hostname’, username=’usrname’, password=’mypassword’)

sftp_client = client.open_sftp()
ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
b_ncfile = ncfile.read()    # ****

nc = Dataset('test.nc', memory=b_ncfile)

但是ncfile.read()的运行速度非常慢。

所以我的问题是：有没有其他方法可以远程读取 netcdf 文件，或者有什么方法可以加速paramiko.sftp_file.SFTPFile.read()？

Answer 1

调用SFTPFile.prefetch 应该会提高读取速度：

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
ncfile.prefetch()
b_ncfile = ncfile.read()

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另一个选项是启用读取缓冲，使用SFTPClient.open 的bufsize 参数：

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile', bufsize=32768)
b_ncfile = ncfile.read()

（32768 是 SFTPFile.MAX_REQUEST_SIZE 的值）

同样适用于写入/上传：
Writing to a file on SFTP server opened using pysftp "open" method is slow。

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另一种选择是明确指定要读取的数据量（它使BufferedFile.read 采用更有效的代码路径）：

ncfile = sftp_client.open('mynetCDFfile')
b_ncfile = ncfile.read(ncfile.stat().st_size)

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如果这些都不起作用，您可以将整个文件下载到内存中：
Use pdfplumber and Paramiko to read a PDF file from an SFTP server

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强制性警告：不要以这种方式使用AutoAddPolicy - 这样做会失去对MITM attacks 的保护。有关正确的解决方案，请参阅Paramiko "Unknown Server"。