【发布时间】:2020-12-18 15:58:51
【问题描述】:
我有一个目录,其中包含大约 500 个目录。在这 500 个目录的每一个中,我想要两个文件,一个以 .bam 结尾,一个以 .bai 结尾。我正在尝试为所有以 .bam 或 .bai 结尾的文件创建指向新位置的符号链接。
我的目录结构如下:
/Parent_Directory/[500_Subdirectories]/file.bam
我的目标目录是:
/New_Directory/bam_folder/
现在,我的当前代码遇到了问题:
for d in Parent_Directory; do
( cd "$d" && ln -s *.ba* New_Directory/Bam_Folder );
done
似乎一直在发生的是,我在我的 Bam_Folder 目录中创建了一个符号链接,指向一个名为 .ba
的不存在的文件文件我到底做错了什么,我该如何解决?谢谢!
【问题讨论】:
-
符号链接不能是相对的。它应该是完整的文件路径。
-
感谢您的帮助!如果目录和文件名是可变的,我将如何为每个目录中的每个文件执行此操作?
标签: linux bash bioinformatics