STRING 数据库 Neo4j 导入答案

【问题标题】：STRING database Neo4j importSTRING 数据库 Neo4j 导入
【发布时间】：2017-05-05 11:31:08
【问题描述】：

我正在从 STRING 数据库处理这个网络。我已经提取了该网络，以便可以将其导入 Neo4j ，我使用的格式是 TSV，我已将其转换为 csv 并完成了导入然而，我只能看到节点，而没有看到它们之间的关系。我怎样才能让 Neo4j 能够知道关系并代表它们这是 STRING 网络：http://string-db.org/cgi/network.pl?taskId=sPvqsEhi3Tk6&sessionId=MKQKZSH3dCb3&bottom_page_content=table

这就是表格形式 [1]：https://i.stack.imgur.com/IMMFk.png 这是 Neo4j 图 [1]：https://i.stack.imgur.com/eKeYv.png

【问题讨论】：

标签： database import neo4j

【解决方案1】：

我认为以下方法可以解决问题：

CREATE CONSTRAINT ON (n:Node) ASSERT a.NodeID IS UNIQUE;
USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM 'file:///strings.csv'
AS line
WITH line
MERGE (n1:Node {NodeID: line.node1_string_internal_id, NodeName: line.node1})
MERGE (n2:Node {NodeID: line.node2_string_internal_id, NodeName: line.node2})
MERGE (n1)-[:INTERACTS {Score: TOFLOAT(line.combined_score)}]->(n2);

我希望这会有所帮助。

问候，汤姆

【讨论】：

我现在试过了，每次查询都得到了预期的语句，但得到：2 错误，对不起，我是 Cypher 的新手
不是问题。您首先需要在浏览器中执行 CREATE 语句，然后执行其余部分。第一条语句（直到第一个“;”）为您的节点创建一个索引（和约束）。第二条语句根据 CSV 中每一行中可以找到的三件事（两个节点以及它们之间的关系）进行实际加载。