neo4j：Cypher 查询中的可选“步骤”

Question

我正在尝试查找具有可选但特定节点/关系的节点之间的关系（neo4j 2.0 M6）。

在我的数据模型中，“基因”可以是“PARTOF”一个“组”。我在“基因”-“基因”、“基因”-“组”和“组”-“组”之间存在“交互”关系（模型图像中的红线）。

我想将其归结为“基因”之间的所有“交互”关系：直接(Gene-INTERACT-Gene) 和通过一两个“组”(Gene-PARTOF-Group-INTERACT-Gene)。

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当然，使用多个 Cypher 查询很容易：

# direct INTERACT
MATCH (g1:Gene)-[r:INTERACT]-(g2:Gene) RETURN g1, g2
# INTERACT via one Group
MATCH (g1:Gene)-[:PARTOF]-(gr:Group)-[r:INTERACT]-(g2:Gene) RETURN g1, g2
# INTERACT via two Group
MATCH (g1:Gene)-[:PARTOF]-(gr1:Group)-[r:INTERACT]-(gr2:Group)-[:PARTOF]-(g2:Gene)
RETURN g1, g2

但是是否可以构建一个在路径中采用可选“组步骤”的 Cypher 查询？到目前为止，我只使用了可选关系和shortestPaths，但我不知道是否可以在两个基因之间过滤一两个可选节点。

Answer 1

您可以为添加到路径的每个关系指定介于 0 和 1 之间的深度。尝试类似

MATCH (g1:Gene)-[:PARTOF*0..1]-(gr1)-[:INTERACT]-(gr2)-[:PARTOF*0..1]-(g2:Gene) 
RETURN g1,g2

要查看匹配路径的实际外观，只需返回整个路径

MATCH p=(g1:Gene)-[:PARTOF*0..1]-(gr1)-[:INTERACT]-(gr2)-[:PARTOF*0..1]-(g2:Gene) 
RETURN p

然而，为这个模式的可选部分声明节点标签有点麻烦，所以这个查询假设基因不是组以外的任何部分，并且它们只与组和其他基因相互作用。如果一个基因可以将[:PARTOF] 绑定到其他东西，那么(gr1) 将绑定那个东西，并且查询不再可靠。只需添加一个 where 子句，如

WHERE gr1:Group AND gr2:Group

排除了可选部分不匹配的情况，因此这不起作用（就像您的第三个查询一样）。我确信它可以解决，但如果您的实际模型并不比您在问题中描述的复杂得多，那么应该这样做。

我冒昧地在控制台 here 中解释了您的模型，请检查它是否符合您的要求。