r circlize 报告 gap.degree 太大

Question

我正在尝试使用 R.circlize 包中的 chordDiagram 函数绘制和弦，参考代码类似于“matrix visualization”

set.seed(999)
chordDiagram(mat)
circos.clear()

错误报告如下：

circos.initialize(factors = factors, xlim = xlim) :
  Maybe your `gap.degree` is too large so that there is no space to allocate sectors.

我的“垫子”看起来像：

> str(mat)
 num [1:421, 1:7] 2 0 2 0 0 0 0 0 0 0 ...
 - attr(*, "dimnames")=List of 2
  ..$ : chr [1:421] "BCM,SCM_2,Accept_Dismiss" "BCM,TCU_2,ActualGear" "BCM,ACM_1,AirbagPassengerLED" "BCM,ACM_1,AirbagWarningLamp" ...
  ..$ : chr [1:7] "MMC,RxBuffer" "IC,RxBuffer" "CCU,RxBuffer" "PEPS,RxBuffer" ...

Answer 1

这是因为您的矩阵有太多行。在您的情况下，如果行和列引用不同的元素，则图中将有 421 + 7 = 428 个扇区。默认情况下，每两个相邻扇区之间存在 1 度宽度的间隙。因此，在您的情况下，间隙总和为 428 度，大于整个圆（360 度），因此没有绘制扇区的空间。