使用 Python 和 Pandas 将合并症数据转换为表格时遇到问题答案

【问题标题】：Trouble turning comorbidity data into a table using Python and Pandas使用 Python 和 Pandas 将合并症数据转换为表格时遇到问题
【发布时间】：2019-09-30 18:34:26
【问题描述】：

我正在尝试从 Kaggle 数据集分析合并症的发生，作为一项极客训练练习。我已经能够从数据集中获得所有 15 种发病率。然而，在这一点上，我很难把它变成一个数据框或类似的东西。

此时我的想法集中在使用发病率列表创建一个 15 x 15 的表格。我想用它来创建径向收敛图。但是，我不知道如何填写这张表（或者如果这甚至是正确的方法......）。

有人可以在编码或此表类型的名称方面向我推动正确的方向吗？

原创 Kaggle； https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays/data/kernels

到目前为止我的脚本；

#Load data
df = pd.read_csv("Data_Entry_2017.csv")

#Filter data
df_filtered = df.iloc[:, 1:6]
df_filtered = df_filtered.drop(df_filtered.columns[[1,2]],axis=1)


#List findings
df_string = df_filtered['Finding Labels']
df_string.str.strip()

findings = []

for finding in df_string:
    finding = finding.split('|')
    for findingX in finding:
        findings.append(findingX)
findingsSolo = list(set(findings))

#df from findings list
df_findings = pd.DataFrame(columns=findingsSolo, index=findingsSolo)

【问题讨论】：

标签： python pandas kaggle chord-diagram

【解决方案1】：

对于那些遇到我的问题的人，经过一番深思熟虑，我想出了一个解决方案；

df_findings = pd.DataFrame(columns=findings, index=findings).fillna(0)

for finding in df_string:
    finding = finding.split('|')
    finding.sort()
    if len(finding) > 1:
        col_label = finding[0]
        for row_label in finding[1::]:
            df_findings.loc[row_label,col_label] += 1

【讨论】：