如何在 Python NetworkX 中编写与 R igraph 相同的代码答案

【问题标题】：How to write in Python NetworkX same code of R igraph如何在 Python NetworkX 中编写与 R igraph 相同的代码
【发布时间】：2020-03-26 10:51:05
【问题描述】：

我的老师使用 R，现在他正在解释图论。我不想使用 R，因为我使用 Python 并且更喜欢它，所以我想学习 NetworkX（NOT Python igraph，因为我在打印图表时遇到很多问题） .

关键是，如果与 R 相比，Python 代码似乎真的很复杂。

我更好地解释自己：你如何实现这个 R 代码

fig <- graph.formula(a-b, c-e-d, i-k-j-g-i, f-g-j-h-f, k-j-h-l-k, h-l-m-h)

在 NetworkX 上？

是否可以只排一排？如果没有，我该怎么办？

谢谢！

【问题讨论】：

你能解释一下 R 代码的作用吗？

标签： python networkx igraph

【解决方案1】：

如果您查看formula 的igraph 文档，您给出的行

fig <- graph.formula(a-b, c-e-d, i-k-j-g-i, f-g-j-h-f, k-j-h-l-k, h-l-m-h)

仅创建具有给定（无向）边和节点的图。所以你只想创建一个graph，你在networkx tutorial（add_edges_from方法）中找到你需要的一切

import networks as nx

graph = nx.Graph() # undirected as desired
graph.add_edges_from([("a", "b"), ("c","e"), ("e","d"), ("i","k"), ("k", "j"), ("j", "g"), ("g", "i")])

如您所见，这需要做更多的工作（前三组之后我就停下来了）。

【讨论】：

【解决方案2】：

你当然可以在networkX中做到这一点。我不知道是否有一条线，但很少。

下面的代码使用您指定的节点和边创建一个有向图，然后绘制它。从理论上讲，可以将所有边添加到一行中（并且有更快的方法），但是此代码为 R 代码的每个逗号分隔部分各有一行，以提高可读性。

import networkx as nx
G = nx.DiGraph() #Creates empty graph
G.add_nodes_from(range(0,13))#Adds nodes
G.add_edges_from([(0,1)])#Adds directed edges
G.add_edges_from([(2,3),(3,4)])
G.add_edges_from([(8,10),(10,9),(9,6),(6,8)])
G.add_edges_from([(5,6),(6,9),(9,7),(7,5)])
G.add_edges_from([(10,9),(9,7),(7,11),(11,10)])
G.add_edges_from([(7,11),(11,12),(12,7)])
nx.draw(G)

【讨论】：