R igraph write.graph() edgelist 如果图为空

【问题标题】：R igraph write.graph() edgelist if graph is emptyR igraph write.graph() edgelist 如果图为空
【发布时间】：2012-09-07 11:38:53
【问题描述】：

在 R 中使用包“igraph”并调用函数：

graph <- graph.empty(10,directed=FALSE)
write.graph(graph,"some/path/graph.txt",format="edgelist")

如果我通过使用来回忆图表

g <- as.undirected(read.graph("some/path/graph.txt",format="edgelist"))

图是空的，但也没有顶点！

【问题讨论】：

标签： r igraph vertex edge-list

【解决方案1】：

一个边列表是一个有 2 列的矩阵，每条边有一行，第一列表示源节点，第二列表示目标节点。由于您没有边缘，因此边缘列表为空，因此您编写的文件为空。

通常edgelist是存储图的最简单方法，节点的数量可以从edgelist中唯一节点名称的数量推断出来（如果节点被编号，则为最大整数，我认为这就是igraph所做的），但是如果有没有边的节点就会出错，

您可以尝试另一种在节点上也存储信息的格式。例如，

library("igraph")

graph <- graph.empty(10,directed=FALSE)
write.graph(graph,"graph.txt",format="pajek")


g <- as.undirected(read.graph("graph.txt",format="pajek"))

【讨论】：