【发布时间】：2009-07-22 22:06:30
【问题描述】：
有人使用 MATLAB 的 javaObject() 函数和使用 JNI 的 JAR 文件吗？
我正在尝试让 JHDF5 运行，当它尝试使用 jhdf5.dll 获取访问权限时，它似乎会爆炸，所以我真的不知道下一步该做什么。 :(
编辑：我不试图读取基本的 HDF5 文件。我有自己的自定义 Java 代码，可以使用 HDF5 并需要 JHDF5 库。另外，我的第一个问题是是否有人成功使用过它。如果不是，那么我可能正在打一场失败的战斗。如果是这样，那么至少它给了我希望。我试试调试，比在Eclipse下调试常规Java代码难度很大。
更新：好的，具体如下。我做了一个非常短的测试类，它的故障模式与我的复杂程序相同。看起来我的 Java 类由于某种原因无法访问 HDF5 静态常量。
我的 MATLAB javaclasspath 设置为包含我的 test-hdf5.jar 和 Test1.java（如下），以及同一目录中的文件 jhdf5.jar、jhdf5.dll、jhdf5obj.jar 和 jhdfobj.jar。
源文件Test1.java：
package com.example.test.hdf5;
import ncsa.hdf.hdf5lib.H5;
import ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants;
import ncsa.hdf.hdf5lib.exceptions.HDF5LibraryException;
import ncsa.hdf.object.FileFormat;
import ncsa.hdf.object.h5.H5File;
public class Test1 {
public Test1 () {}
public static void main(String args[])
{
Test1 test = new Test1();
if (args.length < 2)
{
}
else if ("h5file".equals(args[0]))
{
test.testH5File(args[1]);
}
else if ("h5f".equals(args[0]))
{
test.testH5F(args[1]);
}
}
public void testH5File(String filename) {
H5File file;
try
{
file = (H5File) new H5File().createFile(
filename, FileFormat.FILE_CREATE_OPEN);
file.close();
}
catch (Exception e)
{
throw new RuntimeException(e);
}
}
public void testH5F(String filename) {
try {
int id = H5.H5Fopen(filename,
HDF5Constants.H5F_ACC_RDONLY, HDF5Constants.H5P_DEFAULT);
H5.H5Fclose(id);
}
catch (HDF5LibraryException e) {
throw new RuntimeException(e);
}
catch (NullPointerException e) {
throw new RuntimeException(e);
}
}
}
MATLAB 错误：
>> T=javaObject('com.example.test.hdf5.Test1')
T =
com.example.test.hdf5.Test1@c9a375
>> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5')
java.lang.UnsatisfiedLinkError: no jhdf5 in java.library.path
at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(Unknown Source)
at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Unknown Source)
at java.lang.System.loadLibrary(Unknown Source)
at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.<clinit>(H5.java:276)
at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.<clinit>(HDF5Constants.java:494)
at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46)
Jul 23, 2009 10:38:16 AM ncsa.hdf.hdf5lib.H5 <clinit>
INFO: HDF5 library: jhdf5 resolved to: jhdf5.dll; NOT successfully loaded from java.library.path
??? Java exception occurred:
java.lang.UnsatisfiedLinkError: ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit()I
at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.H5dont_atexit(Native Method)
at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.<clinit>(H5.java:288)
at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.<clinit>(HDF5Constants.java:494)
at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46)
>> T.testH5F('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5')
??? Java exception occurred:
java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants
at com.example.test.hdf5.Test1.testH5F(Test1.java:46)
>> T.testH5File('c:/tmp/espdf/jj11copy.hdf5')
??? Java exception occurred:
java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants
at ncsa.hdf.object.h5.H5File.<init>(H5File.java:167)
at ncsa.hdf.object.h5.H5File.<init>(H5File.java:106)
at com.example.test.hdf5.Test1.testH5File(Test1.java:34)
以防万一，这是我正在使用的 ant 构建文件。 JHDF5 .jar 文件和 .dll 在我的lib 目录中；它们被复制到创建我自己的 .jar 文件的 dist 目录中。
<?xml version="1.0"?>
<project default="all" name="test-hdf5">
<description>some libraries to use later</description>
<property name="srcDir" location="src"/>
<property name="buildDir" location="bin"/>
<property name="distDir" location="dist"/>
<property name="libDir" location="lib"/>
<target name="init">
<tstamp/>
<mkdir dir="${buildDir}"/>
<mkdir dir="${distDir}"/>
</target>
<path id="antclasspath">
<fileset dir="${libDir}">
<include name="*.jar"/>
</fileset>
</path>
<target name="compile" depends="init">
<javac srcdir="${srcDir}"
destdir="${buildDir}"
debug="on"
target="1.6"
classpathref="antclasspath"
/>
</target>
<target name="dist" depends="compile">
<copy todir="${buildDir}">
<fileset dir="${srcDir}">
<include name="*.properties" />
</fileset>
</copy>
<copy todir="${distDir}">
<fileset dir="${libDir}">
<include name="*.dll" />
<include name="*.jar" />
</fileset>
</copy>
<jar destfile="${distDir}/test-hdf5.jar" basedir="${buildDir}"
includes="**">
<manifest>
<attribute name="Built-By" value="${user.name}"/>
<attribute name="Main-Class" value="com.example.test.hdf5.Test1" />
<attribute name="Class-Path" value=". ./jhdf5.jar ./jhdfobj.jar ./jdhf5obj.jar" />
</manifest>
</jar>
</target>
<target name="all" depends="dist" />
<target name="clean" >
<delete dir="${buildDir}" />
</target>
</project>
【问题讨论】：
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常见问题：你做了什么？你期待什么结果？实际结果在哪些方面与您的预期不一致？ “看起来像炸弹”根本没有告诉读者任何事情。
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你尝试运行的代码和你得到的错误信息会有很大帮助。
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这并不直接涉及 JNI 问题，但您可以将 Eclipse 调试器附加到 Matlab 的嵌入式 JVM 以调试在 Matlab 中运行的 Java 代码。在您启动 Matlab 的目录中创建一个名为“java.opts”的文件，并将这一行放入其中。 -agentlib:jdwp=server=y,transport=dt_socket,address=9999 然后启动 Eclipse 和 Matlab。 Matlab 将在启动时阻塞并等待您附加调试器。另外，我同意其他评论者的观点。需要更多详细信息，最好是准确的代码和错误消息。
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@gnovice：同意；值得庆幸的是，使用简短的程序很容易重现故障。否则我将无法发布专有代码：/
标签： java matlab java-native-interface