使用图形工具绘制社区结构的图形答案

【问题标题】：Graph to draw community structure with graph-tool使用图形工具绘制社区结构的图形
【发布时间】：2017-02-02 22:59:34
【问题描述】：

我需要画出大脑网络的社区结构。与所附图像类似。我正在使用图形工具 python 工具箱。任何帮助创建这个将不胜感激。

。

【问题讨论】：

你研究过 Anaconda 吗？
我使用图形工具来执行我的分析，并使用图形工具中的 stochastic_block_models 获取社区结构。我只需要帮助使用图形工具的绘图功能来获得类似于上面的图形。
如果您觉得这个答案有用，请点击旁边的标记接受它。

【解决方案1】：

因此，如果G 是您的图，您可以拟合标准随机块模型（即没有度数校正的模型）以获得社区结构：

state = gt.minimize_blockmodel_dl(G, deg_corr=False)

在此之后，您可以使用 draw 方法，它只是 graph_draw() 的包装器：

state.draw(pos=g.vp.pos, output="my_graph.pdf")

希望这会有所帮助。

【讨论】：

【解决方案2】：

vprop_int = g.new_vertex_property("int")
vprop[g1.vertex(0)] = 5
...

然后您将获得所有顶点的属性在您的情况下，您可能会分配不同的号码那么当你画画的时候

graph_draw(g, vertex_text=g.vertex_index, vertex_font_size=80
           , vertex_fill_color=vprop_int
           , edge_pen_width=20, edge_color=eprop_int
           , output_size=(20000, 20000), output="test.png")

你决定顶点颜色的部分我把

vertex_fill_color=vprop_int

我希望这会有所帮助

【讨论】：