图形工具 GraphML 是否支持彩色顶点？

Question

我正在尝试使用图形工具来绘制带有彩色顶点的网络图。我正在尝试从here 绘制以下 graphML 文件，如下所示。

但是，下面的代码没有显示颜色：

g = Graph()
g= load_graph("filename.graphml", fmt="graphml")
graph_draw(g)

图形呈现，但顶点上没有颜色，仅用于默认红色。我认为 graphML 是完全支持的？

Graph-tool 文档指出：“唯一能够完美保留内部属性映射的文件格式是“gt”和“graphml”。因此，应尽可能优先使用它们而不是其他格式。”

颜色不是内部属性吗？

最初我是在 DOT 中绘图。我有一个颜色数组，其索引取决于节点的名称 - 节点是按递增顺序排列的整数。但是，当我使用时：

for v in g.vertices():
    v_prop[v] = colourarray[vertex]

颜色与正确的节点不对应。这是因为 load_graph 似乎对哪些节点是哪个索引有自己的想法。有人知道我可以在这里做什么吗？

   <graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd">
    <key id="d0" for="node" attr.name="color" attr.type="string">
    <default>yellow</default>
    </key>
    <key id="d1" for="edge" attr.name="weight" attr.type="double"/>
    <graph id="G" edgedefault="undirected">
    <node id="n0">
    <data key="d0">green</data>
    </node>
    <node id="n1"/>
    <node id="n2">
    <data key="d0">blue</data>
    </node>
    <node id="n3">
    <data key="d0">red</data>
    </node>
    <node id="n4"/>
    <node id="n5">
    <data key="d0">turquoise</data>
    </node>
    <edge id="e0" source="n0" target="n2">
    <data key="d1">1.0</data>
    </edge>
    <edge id="e1" source="n0" target="n1">
    <data key="d1">1.0</data>
    </edge>
    <edge id="e2" source="n1" target="n3">
    <data key="d1">2.0</data>
    </edge>
    <edge id="e3" source="n3" target="n2"/>
    <edge id="e4" source="n2" target="n4"/>
    <edge id="e5" source="n3" target="n5"/>
    <edge id="e6" source="n5" target="n4">
    <data key="d1">1.1</data>
    </edge>
    </graph>
    </graphml>

Answer 1

您将属性映射的存在与它实际用于绘图混为一谈。如果你想使用属性映射，你必须明确地这样做：

graph_draw(g, vertex_fill_color=g.vp.color)

请查看文档，其中包含许多此类示例。

dot 和 graphml 文件中存在的固有顶点“名称”作为内部属性映射加载。在点的情况下，属性映射被命名为“vertex_name”：

g.vp.vertex_name

对于graphml，如果顶点标签不规范（即从0到N-1编号），则存储为“_graphml_vertex_id”：

g.vp._graphml_vertex_id