在 R 中通过 hclust 重新排序数据答案

【问题标题】：To reorder a data by hclust in R在 R 中通过 hclust 重新排序数据
【发布时间】：2012-06-07 18:29:29
【问题描述】：

我从这里看到了这些代码：http://learnr.wordpress.com/2009/08/10/ggplot2-version-of-figures-in-lattice-multivariate-data-visualization-with-r-part-9/

hc1 <- hclust(dist(USArrests, method = "canberra"))
hc1 <- as.dendrogram(hc1)
ord.hc1 <- order.dendrogram(hc1)
hc2 <- reorder(hc1, state.region[ord.hc1])
ord.hc2 <- order.dendrogram(hc2)
region.colors <- trellis.par.get("superpose.polygon")$col
USArrests2 <- melt(t(scale(USArrests)))
USArrests2$X2 <- factor(USArrests2$X2, levels = state.name[ord.hc2])

但我在第四行中对state.region 变量感到非常困惑。

关于订单的变量是ord.hc1是从USArrests生成的，这似乎与state.region无关。那为什么它使用state.region 来重新排序而不是USArrests 数据框中的列呢？

【问题讨论】：

你能告诉我哪个包有这些数据吗？
@Subs，它是datasets 的一部分：stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/datasets/html/…
和 state.region 是“每个州所属地区（东北部、南部、中北部、西部）的一个因素。”参看。 stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/datasets/html/…
嗯，你知道的。为什么会有疑问？根据描述，USArrests 包含自 1973 年以来所有 50 个州的犯罪详情。因此，它使用来自state.region 的信息来简化分组。

标签： r statistics

【解决方案1】：

查看state.region的帮助文件-

?state.region

详情下的第一句，是

R currently contains the following "state" data sets.  
Note that all data are arranged according to alphabetical 
order of the state names.

这意味着我们可以在美国数据集之间跳转，因为它们都是相同的顺序，即USArrests的第一个条目的状态与state.region.

【讨论】：