从 python 运行 shell 脚本答案

【问题标题】：Running shell script from python从 python 运行 shell 脚本
【发布时间】：2016-08-28 15:17:13
【问题描述】：

我写了一个小python程序，它写了一个C-shell脚本，然后用子进程调用这个脚本。但是，python 无法执行脚本。我在终端中对此进行了测试，发现该脚本也不会从终端运行（即不是 python 问题）。进一步的测试表明，我可以在文本编辑器 (vi) 中编写相同的脚本，然后从终端成功执行它（即我认为脚本的内容没有问题）。最终我发现，如果我尝试使用./myscript.com 直接在终端中运行 python 的输出，它将不运行。但是，如果我用 vi 打开，进行 NO 更改，保存然后使用./myscript.com（即完全相同的命令）从终端运行，它将执行。该脚本包含在下面，以防万一，但是，大多数内容都非常特定于我要运行的特定程序。我不知道如何进一步调试，也不知道为什么在 vi 中打开、保存和关闭的效果足以让脚本执行。（例如，我已经检查了权限，并且在 vi 步骤之后这些权限没有改变。）任何关于如何进行的建议都非常感谢。

#!/bin/csh
#
bin2pipe -in /full/path/to/this/script/recon.spc -bad 0.0 -noswap \
-xN 1714 \
-xT 1714 \
-xFT Freq \
-xMODE Real \
-xSW 4184.570312 \
-xCAR 10.929523 \
-xOBS 800.130005 \
-xLAB 1H \
-yN 2048 \
-yT 2048 \
-yFT Freq \
-yMODE Real \
-ySW 1700.680054 \
-yCAR 125.728023 \
-yOBS 81.075996 \
-yLAB 1H \
-ndim 2 \
|nmrPipe -fn TP -auto \
|nmrPipe -fn REV \
|nmrPipe -fn TP -auto \
-out recon.spc.pipe.ft2 -ov -verb

【问题讨论】：

你是如何从 Python 中调用它的？
从 python 我把它称为subprocess.call(FileName)，之前设置了文件权限，所以它可以用os.chmod(FileName, 0o755) 执行我注意到的一件事是在 vi 中打开、保存和关闭会增加 1 个字节文件大小（492 到 493 字节）。我不知道这是否重要，或者这个额外的字节被添加到哪里。
您可以逐字节比较这两个文件，看看有什么不同。 换行符是等价的吗？ Unicode 与 ascii？
将 shebang 更改为 #!/bin/sh 可能无济于事，但出于其他原因强烈推荐。
需要正确调用文件subprocess.call(["/bin/csh", "/full/path/to/file"])

标签： python shell unix vi csh

【解决方案1】：

如果这很有用，我使用 xxd（如上面的 cmets 中建议的 http://linuxcommand.org/man_pages/xxd1.html）将两个脚本文件（一个用 python 创建，一个手动编写）转换为十六进制

xxd script.txt output.txt

然后我将这两个文件的输出与diff 进行比较，可以在文件末尾看到一个额外的十六进制字符0a。这对应于换行符。如Why should text files end with a newline? 和VIM Disable Automatic Newline At End Of File 的详细说明，vi 在文件末尾添加一个换行符（如果没有的话）。这使脚本能够运行。最后没有换行符（我没有包含在 python 脚本中），脚本将无法运行。

【讨论】：