我怎么知道我的 qsub 作业在哪里运行/正在编写答案

【问题标题】：How do I know where my qsub job is running/being written我怎么知道我的 qsub 作业在哪里运行/正在编写
【发布时间】：2016-10-11 12:44:05
【问题描述】：

也许是一个关于 SGE 上 qsub 的愚蠢问题。

我通过脚本提交作业

#PBS -V
#PBS -l select=1:ncpus=20:mpiprocs=20,walltime=01:00:00 
#PBS -o /path/to/out.file
#PBS -e /path/to/errors.txt
#PBS -q smp
#PBS -m ae
#PBS -M myemail@address
#PBS -P Projectname
#PBS -I
#PBS -N Job

 mpirun -np 20 mpiexecutable args input.file

“mpiexecutable”的工作是作用于 input.file 以最小化其参数，然后将它们再次写入 input.file。

我的工作正在运行。但 input.file 保持不变。我认为要么有

1) 我的 PATH 中缺少某些东西，或者

2) 集群不写入 input.file 的其他一些原因。

为了解决它，我需要知道：

1) 我如何找出作业正在运行的位置（即作业运行的路径是什么 - 应该与工作目录中的路径相同，当然？） 2) 我如何知道作业的地址？

非常感谢您的帮助！

【问题讨论】：

标签： qsub

【解决方案1】：

我刚刚取得了一些进展！我认为解决此类问题的最佳方法是明确说明作业在哪里运行和编写，以及在哪里可以找到可执行文件和输入等。

考虑到这一点，我的新提交脚本是：

 #PBS -V
 #PBS -l select=1:ncpus=20:mpiprocs=20,walltime=01:00:00 
 #PBS -o /path/lfor/out.txt
 #PBS -e /path/for/errors.txt
 #PBS -q smp
 #PBS -m ae
 #PBS -M email@address
 #PBS -P Project-name
 #PBS -I
 #PBS -N Job

 module load importantmodules

 SRCDIR=$SCRATCH/my_project/code

 cp my_input_params.inp $RUNDIR

 RUNDIR=$SCRATCH/my_project/run-${PBS_JOBID/.*}

 mkdir -p $RUNDIR

 mpirun -np 20 $SRCDIR/mpiexecutable args < my_input_file.inp

我还没有尝试过，但我祈祷它有效。我从这个网站得到了一些改进提交脚本的很好的指令：https://wikis.nyu.edu/display/NYUHPC/Writing+and+submitting+a+job+-+content

让我们继续前进！我现在感觉少了一点迷茫

【讨论】：