在所有子目录中运行 qsub 命令

Question

我在 HPC 上使用 Centos 来运行我的代码。我通常有一个文件夹，其中包含一个 run_calc 文件，这是我想要运行的：

qsub run_calc

现在我想编写一个脚本“submit_all.sh”，它提交当前目录中所有子文件夹中的所有 run_calc 文件，而不是来自我运行 submit_all.sh 脚本的父文件夹。

我在Solution 和Solution2 发现了类似的问题 这似乎是这个问题的部分答案。在找到解决方案之前，我对提交脚本没有信心，这就是我问的原因：

在第二个链接中我找到了这个解决方案：

for i in {1..1000}; do
    cd "$i"
    qsub submit.sh
    cd ..
done

“i”是名称为 1-100 的文件夹列表。是否可以使用 find 创建所有子目录的列表并将其路径到 for 循环？我将如何处理子子目录？我是否可以更改 cd .. 语句，以便在这种情况下我总是直接返回父文件夹？

我喜欢这个解决方案：Solution

#!/bin/sh

for i in `find /var/www -type d -maxdepth 1 -mindepth 1`; do
   cd $i
   # do something here
done

但我不明白这是怎么回事？是否可以将上述脚本更改为只潜入包含 run_calc 文件并包含子子目录的文件夹？

提前谢谢你

Answer 1

假设您使用bash 作为您的外壳：

$ cat ./test.sh
#!/bin/bash

IFS=$'\n' 
while read -r fname ; 
do 
    pushd $(dirname "${fname}") > /dev/null
    qsub run_calc 
    popd > /dev/null 
done < <(find . -type f -name 'run_calc')

find . -type f -name 'run_calc' 在当前目录及其子目录中查找文件run_calc 的所有路径。这是while loop 的输入。

pushd, popd 是 bash 特定的，并添加或弹出目录堆栈。

Answer 2

for d in `find . -type d`
do ( cd "$d"
     if test ! -f run_calc; then continue; fi
     qsub run_calc
) done

( commnds ) 在单独的进程中执行commands，cd 的效果不会“泄漏”。