【发布时间】:2015-01-07 15:43:47
【问题描述】:
我正在处理一个 XML 数据集(DrugBank 数据库可用here),其中一些字段包含转义的 XML 字符,如“&”等。
为了使问题更具体,这里是一个示例场景:
<drugs>
<drug>
<drugbank-id>DB00001</drugbank-id>
<general-references>
# Askari AT, Lincoff AM: Antithrombotic Drug Therapy in Cardiovascular Disease. 2009 Oct; pp. 440–. ISBN 9781603272346. "Google books":http://books.google.com/books?id=iadLoXoQkWEC&pg=PA440.
</general-references>
.
</drug>
<drug>
...
</drug>
...
</drugs>
由于整个文档很大,我解析如下:
VTDGen gen = new VTDGen();
try {
gen.setDoc(Files.readAllBytes(DRUGBANK_XML));
gen.parse(true);
} catch (IOException | ParseException e) {
SystemHelper.exitWithMessage(e, "Unable to process Drugbank XML data. Aborting.");
}
VTDNav nav = gen.getNav();
AutoPilot pilot = new AutoPilot(nav);
pilot.selectXPath("//drugs/drug");
while (pilot.evalXPath() != -1) {
long fragment = nav.getContentFragment();
String drugXML = nav.toString((int) fragment, (int) (fragment >> 32));
System.out.println(drugXML);
finerParse(drugXML); // another method handling a more detailed data analysis
}
当我使用示例 xml(从相同数据复制粘贴的 sn-ps 方法)测试 finerParse 方法时,它运行良好。但是当从上面的代码调用时,它失败了,错误消息Errors in Entity: Illegal entity char。在将输入打印到finerParse(即drugXML 字符串)后,我注意到原始xml 中的字符串&amp;pg=PA440 已更改为“&pg=PA440”。
为什么会这样?我所做的只是使用一个非常知名的解析器来解析它。
附:我已经找到了一个替代解决方案,我只是将 VTDNav 作为参数传递给finerParse,而不是首先获取内容字符串并传递该字符串。但是我仍然对上述方法出了什么问题感到好奇。
【问题讨论】:
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还有一个建议:永远不要传递字符串,你应该传递字节段,将字符串传递给另一个函数效率不高。
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感谢您的建议。我目前的方法是将 VTDNav 本身传递给
finerParse。我没有做过任何基准测试,但直观地说,这应该是最有效的方法。我只需要注意正确使用toElement(int, String)方法。如果我在这里错了,请纠正。