有没有办法在 Pandas 数据框中建立 neo4j 的关系？答案

【问题标题】：Is there any way to make relationship of neo4j in Pandas dataframe?有没有办法在 Pandas 数据框中建立 neo4j 的关系？
【发布时间】：2021-09-23 07:58:47
【问题描述】：

我已经使用py2neo 包创建了节点

from py2neo import Graph
from py2neo import Node

这是我的熊猫数据框

我可以成功创建节点。

我一直在尝试处理出现错误的关系！

graph.create(Relationship(pmid, "Having_author", auth))

TypeError: 类型的值不受支持

我也提到了堆栈溢出问题，但仍然出现错误！

Here is the link

还有其他方法可以与 pandas 数据框建立关系吗？

【问题讨论】：

标签： python-3.x pandas dataframe neo4j relationship

【解决方案1】：

您的代码失败，因为节点的 ID 必须是文字（整数或字符串），但您在编写 ...id = data['PMID']) 时将 ID 设置为系列。看起来py2neo 允许您创建具有错误 ID 的节点对象，但实际上不应该，因为与该节点的所有关系都将失败，因为 ID 错误。

使用整数作为 ID 重新创建节点类，然后创建它们之间的关系应该没有问题。

注意，我还没有测试过这段代码，但这是您循环 df 并在执行过程中创建节点的方式。

for i, row in data.iterrows():
    pmid = row['PMID'] #this is the integer PMID based on your df
    pmi_node = Node("PMID row " + str(i), id=pmid) #create node

    authid = row['AU'] #this is a string author name based on your df
    auth_node = Node("Auth row " + str(i), id=authid) #create node

    graph.create(pmi_node | auth_node)

    #create a relationship between the PMI and Auth for that row
    graph.create(Relationship(pmi_node , "Having_author", auth_node))

PS -- 您引用的 SO 链接没有使用 py2neo 包，而是使用 neo4j python 包将密码字符串发送到数据库。如果您是初学者，我会推荐这条路线。

【讨论】：

我已经尝试使用代码 pmid.astype(int) 但仍然面临问题............
类型错误：未知节点类型0 20301691 1 33237688 2 26903338 3 24741715 4 25299040 ... 4232 26065577 4233 26065544 4234 26065469 4235 26065462 4236 26065451名称：PMID，长度：4237，D型细胞：INT32 跨度>
看来您需要了解更多有关 pandas 数据类的信息。您不能将 Series 直接转换为整数。你期望它做什么，总结所有条目？连接？您需要为每个条目单独创建一个节点，而不是尝试从整个系列中创建单个节点。我用示例代码块编辑了我的答案。
您已经编写了 data.iterrows() 但如果您知道系列对象抛出错误，则无法迭代系列对象............
在您的屏幕截图中，数据是一个数据框，而不是一个系列。如果您更改了代码中的 data，请发布更新。

【解决方案2】：

我在 zip 中转换了系列对象，然后它对我有用

for pmid, au in tqdm(zip(data.PMID, data.AU),total = data.shape[0]):
    pmid_node = Node("pmid", name=int(pmid))
    au_node = Node("author", name=au)
    graph.create(Relationship(pmid_node, "HAVING_AUTHOR", au_node))

【讨论】：