从 PosixPath、Python 读取 DICOM 对象答案

【问题标题】：Read DICOM objects from PosixPath, Python从 PosixPath、Python 读取 DICOM 对象
【发布时间】：2018-03-04 15:46:26
【问题描述】：

我有 20,000 个 PosixPath，每个都指向一个不同的 .dcm 对象。我需要一一阅读 .dcm 对象。到目前为止，这是我的代码：

from pathlib import Path
import glob
import dicom
data = Path('/data')
path_to_dcm_objects = list(data.glob('**/*.dcm'))
for i in len(path_to_dcm_objects):
    record = dicom.read_file(path_to_dcm_objects[i])

当我想使用其 PosixPath 读取 .dcm 文件时出现错误：

AttributeError: 'PosixPath' object has no attribute 'read'

任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

你确定这不是import pydicom的意思吗？
@MikeMüller 我用pip install pydicom 安装。然后我使用import dicom 来使用该模块。系统无法识别import pydicom
我明白了此代码使用的是旧版本的 pydicom，该版本自 2017 年 1 月起不再维护。您可以通过从 PyPI 安装 pydicom 来访问新的 pydicom 功能和 API。有关详细信息，请参阅 pydicom.readthedocs.org 上的“过渡到 pydicom 1.x”部分。
@MikeMüller 我会检查一下。非常感谢！

标签： python path pydicom

【解决方案1】：

dicom.read_file() 需要打开的文件对象或路径字符串，而不是 Path 实例。如果它不是字符串，则认为它是一个打开的文件并尝试从中读取。

将Path 实例转换为带有str(path_object) 的字符串：

for i in len(path_to_dcm_objects):
    record = dicom.read_file(str(path_to_dcm_objects[i]))

Path对象转字符串的帮助：

返回路径的字符串表示形式，适用于传递给系统调用。

你也可以使用：

 path_object.as_posix()

这会给你一个 Posix 路径：

用正向（/）返回路径的字符串表示斜线。

顺便说一句，遍历所有路径的 Python 方式看起来更像这样：

for path_obj in data.glob('**/*.dcm'):
    record = dicom.read_file(str(path_obj))

【讨论】：

正是我想要的！我很感激！