在 python 丢失内容上查看 DICOM 文件时支持 pydicom 库

Question

我正在使用 pydicom 库查看 DICOM 文件，如图 2 所示，但我想找出数字 3。 我不知道该怎么做。 你帮助指导我。 谢谢你

import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import pylab
import pydicom

filename = 'newfilename.dcm'
dataset = pydicom.dcmread(filename)
plt.imshow(dataset.pixel_array, cmap=pylab.cm.bone)
plt.show()

Link image error

Answer 1

您的问题与所谓的“窗口化”有关。由于 DICOM 文件中的灰度范围（通常：-1000...+4000）高于标准显示系统可以显示的灰度范围（0..255），因此会从图像中提取灰度范围.低于该范围的灰度值被映射为黑色；高于该范围的灰度值被映射为白色。

pylab.cm.bone

说窗口已被调整以强调骨骼，这是您发布的图像中的情况。我查看了颜色贴图的文档，但似乎没有其他值适合我（也许使用不同的颜色贴图会有所帮助）。我建议您根据图像的直方图或图像的 DICOM 标头中的窗口设置（属性 (0028,1050) 和 (0028,1051)）计算自己的颜色图。DICOM Standard, Part 3, C.11.2解释如何根据窗口值计算 LUT。