匿名化后如何以dicom格式保存Dicom图像？

Question

• 我读取了包含所有元数据的 dicom 图像，并对某些字段进行了匿名化，之后我想再次编写它，但出现错误：if None in (dataset.is_little_endian, dataset.is_implicit_VR): AttributeError: 'dict' object has no attribute 'is_little_endian'
• 我看了documentation of pydicom，但不明白怎么做！
• 如何在一个工作指令中重新编写它？
• 编辑：出生日期更改为 None 而不是 'None'，并且 dcmwrite 被替换为 save_as。

import pydicom
from pydicom.misc import is_dicom

fp ='1.dcm'
dico = pydicom.filereader.dcmread(fp)
if(is_dicom(dico)):
        dico['PatientID']= 'None'
        dico['PatientBirthDate'] = None
        dico['is_little_endian'] = True
        dico['is_implicit_VR'] = True
        path = '/dataset'
        # dico.save_as(os.path.join(path,'Anonymous.dcm'))
        pydicom.dcmwrite(os.path.join(path,'Anonymous.dcm'), dico)

Answer 1

好的，如果您在第一次尝试中使用save_as，那么它实际上应该可以工作。这是应该工作的代码：

import pydicom
from pydicom.misc import is_dicom

dico = pydicom.filereader.dcmread('1.dcm')
dico.PatientID = 'None'
dico.PatientBirthDate = None
path = '/dataset'
dico.save_as(os.path.join(path,'Anonymous.dcm'))
# alternatively:
# dcmwrite(os.path.join(path,'Anonymous.dcm', dico)

请注意，我已将 dico['PatientID'] 更改为 dico.PatientID。这不仅是一个方便的快捷方式，而且改变了语义：如果你分配给dico['PatientID']，你必须分配一个DataElement：

dico['PatientID'] = DataElement(0x00100020, 'PN', b'None')

而如果使用关键字，则可以直接分配值（在内部转换为DataElement）。

我同意文档在这方面有些欠缺 - 我认为添加一个简单的示例来读取 DICOM 文件、修改它并写回它是有意义的。但是，如果您查看the basic dataset documentation，您应该会找到大部分需要的信息。

关于上述属性is_little_endian 和is_implicit_VR 的注释：仅当您编写没有设置传输语法的新数据集时才需要这些属性。 Here 就是这种情况的一个例子。如果数据集是从有效的 DICOM 文件中读取的，则它已经设置了这些属性。