【发布时间】:2018-04-24 10:29:54
【问题描述】:
我是新手,是编码的初学者。 目前,我正计划自己编写一个自动编码器来减少功能。 虽然我大部分时间都通过查看网站和书籍来解决我遇到的错误,但我仍然在调试。
dtypes 是 float64(5),Row 和 column 是 (37310, 5)。
任何 cmets 都应该有帮助。 提前谢谢你!
data1 = pd.read_csv("Omics small data3.csv")
df = pd.DataFrame(data1)
KA = df.as_matrix()
KA.shape
KA = Variable(np.array([37310, 5]).astype(np.float))
X = np.array(KA)
class MyAE(Chain):
def __init__(self):
super(MyAE, self).__init__(
l1=L.Linear(500,100),
l2=L.Linear(100,500),
)
def __call__(self,x):
bv = self.fwd(x)
return F.mean_squared_error(bv, x)
def fwd(self,x):
h1 = (self.l1(x))
h2 = F.sigmoid(self.l2(h1))
bv = self.l3(h2)
return bv
model = MyAE()
optimizer = optimizers.SGD()
optimizer.setup(model)
n = 150
bs = 30
for i in range(0, n, bs):
x = Variable(X)
model.cleargrads()
loss = model(x)
loss.backword()
optimizer.updata()
import matplotlib.pyplot as plt
x = Variable(X)
y = F.sigmoid(model.l1(x))
plt.scatter(x, y)
【问题讨论】:
-
这里有很多“输入代码”...您能否正确格式化您的代码...
-
是的,我会努力的。
-
给您带来的不便,我深表歉意。
-
整个错误信息是什么?
-
抱歉回复晚了。它说... x_type.shape[1] == w_type.shape[1], IndexError: tuple index out of range 你知道吗?谢谢。
标签: python autoencoder chainer