PCA 分析去除质心

【问题标题】：PCA analysis remove centroidPCA 分析去除质心
【发布时间】：2017-10-27 14:44:34
【问题描述】：

我正在使用fviz_pca_ind 制作 PCA 图，如下所示。

 fviz_pca_ind(res.pca,  geom="point",  pointsize = 1, habillage=iris$Species, addEllipses=TRUE, ellipse.level=0.95
             , palette = c("green", "orange", "grey"))

我想移除质心，但保留使用 habillage=iris$Species 获得的不同颜色和椭圆。

col.ind 需要一个元素数等于行数的向量。

【问题讨论】：

标签： r pca factoextra

【解决方案1】：

这是一种去除质心的方法：

library(factoextra)
data(iris)
res.pca <- prcomp(iris[, -5],  scale = TRUE)
fviz(res.pca, element="ind", geom="point",  pointsize = 1, 
              habillage=iris$Species, addEllipses=TRUE, ellipse.level=0.95, 
              palette = c("green", "orange", "grey"), invisible="quali")

【讨论】：