OWL ObjectProperty 在 Protégé 中作为注释加载答案

【问题标题】：OWL ObjectProperty loading as annotation in ProtégéOWL ObjectProperty 在 Protégé 中作为注释加载
【发布时间】：2013-04-13 13:29:17
【问题描述】：

我正在尝试在 Protégé 中加载 ontology，但未按预期处理。最大的问题是所有的 Object 和 Data Properties 都显示为 Annotation 而不是 Data Property 和 Object Property。

我有一个对象属性王国：

<owl:ObjectProperty rdf:about="&wo;kingdom">
    <rdfs:label xml:lang="en">kingdom</rdfs:label>
    <rdfs:comment xml:lang="en">associates a taxon rank with a kingdom</rdfs:comment>
    <vs:term_status>testing</vs:term_status>
    <rdfs:range rdf:resource="&wo;Kingdom"/>
    <rdfs:domain rdf:resource="&wo;TaxonRank"/>
</owl:ObjectProperty>

/nature/life/Chordate#kingdom 的值为 /nature/life/Animal#kingdom 作为它的王国：

<wo:Phylum rdf:about="/nature/life/Chordate#kingdom">
    <rdfs:label>Vertebrates</rdfs:label>
    <wo:kingdom rdf:resource="/nature/life/Animal#kingdom"/>
</wo:Phylum>

但是，在 Protégé 中，该属性显示为注释。我不明白为什么它没有显示为王国的对象属性。

这是为什么？

【问题讨论】：

我可以在本体中找到第一个 sn-p 代码（序列化为 RDF/XML），但找不到第二个。你能告诉我它是哪个行号吗？您提到的第一个对象属性 (kingdom) 在 Protege 4.2 中正确显示
这是我正在使用的 rdf 文件的链接，dl.dropboxusercontent.com/u/108022472/index.rdf，在附件中，我只加载了足够的内容来查看问题。我已经加载了所有需要的数据来代表这个人bbc.co.uk/nature/life/Nephrurus，即王国、动物、爬行动物。如果您看到名为“Geckos”且类型为“Family”且具有 IRI bbc.co.uk/nature/life/Gecko#family 的个人，它具有所有数据和对象属性作为注释，这实际上是我遇到的问题。
我在文件中找到了以下个人：<owl:NamedIndividual rdf:about="http://dbpedia.org/resource/Gecko"><owl:sameAs rdf:resource="http://www.bbc.co.uk/nature/life/Gecko#family"/></owl:NamedIndividual>，但是没有附加注释。我还是找不到第二个代码sn-p。
好的，当我在 Protege 中查看单个壁虎时，我看到的是这样的，dl.dropboxusercontent.com/u/108022472/gecko.png
@loopasam，正如你所说，我在文件中没有看到任何注释，仍有对象属性被视为注释

标签： rdf ontology owl protege

【解决方案1】：

这似乎是 Protege 中的一个错误。如何解决：

使用 Protege 打开您的文件index.rdf，导入一些文件需要一些时间。
以RDF/XML格式保存本体，在需要放置的时候选择文件夹，命名为ontology.owl。扩展名很重要，请将其保存为 OWL 文件。
关闭 Protege 并重新打开，打开文件ontology.owl，您现在应该可以看到属性正确显示了。

为什么要这样做？我相信 Protege 对 .rdf 感到困惑并错误地解释了数据。

【讨论】：

对于 TaxonName 类型的“动物”个体，除 wo:kingdomName 之外的所有个体都显示为注释
本体使用了类似scientificName的模糊属性，它们同时被声明为注解属性和数据属性。因为那个 Protege 对展示哪一个感到困惑。您必须转换/删除注释属性以消除歧义，应该可以通过从 OWL 文件中删除 <owl:AnnotationProperty rdf:about="http://purl.org/ontology/wo/scientificName">...</owl:AnnotationProperty> 之类的块来做到这一点。
当您删除 AnnotationProperty 时，它真的对您有用吗？因为对我来说，当我删除注释时，现在不会出现注释，因为我当然已经删除了它，甚至没有删除数据属性
我已经尝试使用scientificName 并且它有效，您只需删除注释属性并确保删除附加到它们的所有 XML 块。
不幸的是，我删除了所有，事实上，我创建了一个小python脚本来完成它但仍然没有解决数据属性的问题。那是我的ontology.owl。此外，这个textfile 包括我正在使用的所有导入，包括删除注释属性的 python 脚本

【解决方案2】：

如果您发现您的对象属性显示为注解，解决方案是导出为本体。这会将您的注释变成类。

【讨论】：

【解决方案3】：

当我将本体保存为 RDF/XML 格式时，实例的对象属性变为注释。但是，如果本体保存为Turtle语法，再次用protege打开时，对象属性会正常显示。

【讨论】：